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EcoSIS NGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska (reflectance)

ecosis · NIR

EcoSIS NGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska (reflectance). v2.0 standardized NIRS package: 1 spectral source(s), 2 declared target(s). Auto-generated from dataset_card.json (verify before publication).

nirv2ecosis
511
samples
2,151
wavelengths
1
sources
2
targets
27
metadata
NIR
family

Dataset property explorer

Mean profile risk0.63
Highest axisArtefacts locaux · 1.00
Diagnostics8
Sources profiled1
EcoSIS NGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska (reflectance) property profile0.250.50.751integritynoiseartefactsbaselinePCA outliersreferencerepeatabilitystructureEcoSIS NGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska (reflectance) profileintegrity: 0.00noise: 0.00artefacts: 1.00baseline: 1.00PCA outliers: 1.00reference: 1.00repeatability: 0.00structure: 1.00EcoSIS NGEE Arc…0 center · 1 outer ring · outward = stronger anomaly / heterogeneity signal

Profile axes

Intégrité0.00
Artefacts locaux1.00
Bruit0.00
Outliers PCA1.00
Distance à la référence1.00
Répétabilité0.00
Baseline / forme1.00
Structure multi-régimes1.00
Diagnostic hypotheses00.250.50.751hypothesis scoreSplice / raccord détecteursSplice / raccord détecteurs: 0.940.94Spectre saturé / clippingSpectre saturé / clipping: 0.920.92Erreur calibration / référenc…Erreur calibration / référence blanche: 0.880.88Fond différentFond différent: 0.830.83Signature VERA25-likeSignature VERA25-like: 0.790.79Erreur interpolation / réécha…Erreur interpolation / rééchantillonnage: 0.780.78Spectre hors domaine valideSpectre hors domaine valide: 0.740.74Différence de sonde / géométr…Différence de sonde / géométrie: 0.720.72
DiagnosticScoreForceSignauxInterprétation probable
Splice / raccord détecteursX0.94fortePCA Q 1.00, Spike rate 1.00, Jump rate 1.00Rupture aux jonctions de détecteurs, calibration locale ou sonde différente.
Spectre saturé / clippingX0.92forteClip fraction 1.00, PCA Q 1.00, Baseline/mean/area 1.00Détecteur saturé ou dynamique insuffisante.
Erreur calibration / référence blancheX0.88fortePCA Q 1.00, Mahalanobis / T2 1.00, Baseline/mean/area 1.00Décalage systématique entre campagnes, instruments ou référence blanche.
Fond différentX0.83fortePCA Q 1.00, Mahalanobis / T2 1.00, Baseline/mean/area 1.00Effet systématique du support, blanc/noir, transflectance ou environnement de mesure.
Signature VERA25-likeX0.79fortePCA Q 1.00, Mahalanobis / T2 1.00, Spike rate 1.00Combinaison possible changement de sonde + splice, amplifiée par géométrie, fond ou calibration.
Erreur interpolation / rééchantillonnageX0.78fortePCA Q 1.00, Spike rate 1.00, Jump rate 1.00Artefacts numériques ou traitement spectral incorrect.
Spectre hors domaine valideX0.74forteMahalanobis / T2 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Structure PCA 1.00Variété, espèce, lot ou condition différente mais physiquement plausible.
Différence de sonde / géométrieX0.72fortePCA Q 1.00, Mahalanobis / T2 1.00, Baseline/mean/area 1.00Modification de l'illumination, collecte, angle ou distance sonde-échantillon.

Spectral sources

Seward_2017_Canopy_Spectral_Reflectance.csv

X · NIR · Spectra Vista Corporation HR-1024i
Seward_2017_Canopy_Spectral_Reflectance.csv spectra05010015020001,0002,0003,000q05-q95 envelopeq25-q75 envelopemedian spectrummedianq25–q75q05–q95wavelength / nm350nm — median 1.655 (q25–q75 1.368–2.007)365nm — median 1.655 (q25–q75 1.369–2.031)381nm — median 1.719 (q25–q75 1.393–2.113)396nm — median 1.78 (q25–q75 1.456–2.199)412nm — median 1.839 (q25–q75 1.473–2.32)427nm — median 1.967 (q25–q75 1.587–2.506)443nm — median 2.143 (q25–q75 1.769–2.8)458nm — median 2.309 (q25–q75 1.905–3.012)474nm — median 2.433 (q25–q75 1.985–3.197)489nm — median 2.537 (q25–q75 2.064–3.327)505nm — median 2.865 (q25–q75 2.349–3.676)520nm — median 3.986 (q25–q75 3.365–4.925)536nm — median 5.568 (q25–q75 4.688–6.582)551nm — median 6.152 (q25–q75 5.179–7.319)567nm — median 5.982 (q25–q75 4.936–7.131)582nm — median 5.237 (q25–q75 4.289–6.482)597nm — median 5.072 (q25–q75 4.066–6.459)613nm — median 4.833 (q25–q75 3.801–6.262)628nm — median 4.633 (q25–q75 3.587–6.219)644nm — median 4.373 (q25–q75 3.351–6.053)659nm — median 4.018 (q25–q75 3.028–5.706)675nm — median 3.717 (q25–q75 2.822–5.481)690nm — median 5.172 (q25–q75 3.945–7.004)706nm — median 12.43 (q25–q75 10.48–14.35)721nm — median 20.33 (q25–q75 16.96–23.49)737nm — median 27.1 (q25–q75 22.02–32.77)752nm — median 30.12 (q25–q75 24.41–36.84)768nm — median 31.71 (q25–q75 25.7–38.52)783nm — median 32.59 (q25–q75 26.52–39.52)799nm — median 33.52 (q25–q75 27.47–40.43)814nm — median 34.54 (q25–q75 28.22–41.35)829nm — median 35.15 (q25–q75 28.93–42.09)845nm — median 36.04 (q25–q75 29.78–42.94)860nm — median 36.74 (q25–q75 30.39–43.71)876nm — median 37.58 (q25–q75 31.2–44.66)891nm — median 38 (q25–q75 31.83–45.25)907nm — median 38.7 (q25–q75 32.17–45.62)922nm — median 39.31 (q25–q75 32.55–46.04)938nm — median 38.74 (q25–q75 31.9–45.13)953nm — median 38.75 (q25–q75 31.95–44.8)969nm — median 38.94 (q25–q75 32.55–44.87)984nm — median 39.11 (q25–q75 32.93–45.09)1,000nm — median 39.72 (q25–q75 33.47–45.85)1,015nm — median 40.68 (q25–q75 34.23–47.1)1,031nm — median 41.79 (q25–q75 35.16–48.26)1,046nm — median 42.61 (q25–q75 35.96–49.07)1,062nm — median 43.4 (q25–q75 36.72–49.86)1,077nm — median 43.94 (q25–q75 37.16–50.4)1,092nm — median 44.13 (q25–q75 37.25–50.65)1,108nm — median 44.13 (q25–q75 37.14–50.28)1,123nm — median 42.53 (q25–q75 35.54–49.05)1,139nm — median 41.62 (q25–q75 34.69–47.43)1,154nm — median 39.62 (q25–q75 33.24–45)1,170nm — median 38.99 (q25–q75 33.13–44.5)1,185nm — median 38.69 (q25–q75 32.9–44.13)1,201nm — median 38.75 (q25–q75 32.81–44.29)1,216nm — median 39.28 (q25–q75 33.33–44.96)1,232nm — median 40.38 (q25–q75 34.35–46.29)1,247nm — median 41.25 (q25–q75 35.06–46.99)1,263nm — median 41.66 (q25–q75 35.69–47.64)1,278nm — median 41.9 (q25–q75 35.88–47.89)1,294nm — median 41.64 (q25–q75 35.55–47.89)1,309nm — median 40.84 (q25–q75 34.56–46.88)1,324nm — median 38.73 (q25–q75 32.04–45.05)1,340nm — median 35.89 (q25–q75 29.45–42.4)1,355nm — median 32.74 (q25–q75 27.29–38.1)1,371nm — median 30.14 (q25–q75 25.01–35.22)1,386nm — median 29.6 (q25–q75 24.5–34.15)1,402nm — median 29.06 (q25–q75 23.69–33.66)1,417nm — median 24.15 (q25–q75 19.32–28.84)1,433nm — median 19.93 (q25–q75 15.63–24.22)1,448nm — median 16.8 (q25–q75 12.87–20.49)1,464nm — median 15.53 (q25–q75 12.37–19.18)1,479nm — median 15.55 (q25–q75 12.41–19.52)1,495nm — median 14.85 (q25–q75 11.47–18.75)1,510nm — median 15.74 (q25–q75 12.28–19.62)1,526nm — median 16.83 (q25–q75 13.34–21.04)1,541nm — median 17.99 (q25–q75 14.46–22.31)1,556nm — median 19.21 (q25–q75 15.51–23.56)1,572nm — median 20.26 (q25–q75 16.49–24.83)1,587nm — median 21.23 (q25–q75 17.23–25.84)1,603nm — median 22.2 (q25–q75 18.06–26.94)1,618nm — median 23.05 (q25–q75 18.55–27.83)1,634nm — median 23.68 (q25–q75 19.14–28.6)1,649nm — median 24.13 (q25–q75 19.53–29.08)1,665nm — median 24.17 (q25–q75 19.5–28.99)1,680nm — median 24.13 (q25–q75 19.56–28.98)1,696nm — median 23.67 (q25–q75 19.13–28.41)1,711nm — median 22.9 (q25–q75 18.48–27.52)1,727nm — median 22.21 (q25–q75 17.9–26.9)1,742nm — median 21.79 (q25–q75 17.66–26.68)1,758nm — median 21.15 (q25–q75 17.12–26.09)1,773nm — median 20.91 (q25–q75 16.81–25.72)1,788nm — median 20.98 (q25–q75 16.89–26.07)1,804nm — median 23.71 (q25–q75 19.19–28.25)1,819nm — median 28.83 (q25–q75 23.29–34.54)1,835nm — median 30.69 (q25–q75 25.37–35.61)1,850nm — median 31.31 (q25–q75 25.87–36.05)1,866nm — median 31.28 (q25–q75 25.51–36.44)1,881nm — median 31.35 (q25–q75 25.28–36.46)1,897nm — median 31.18 (q25–q75 25.85–37.17)1,912nm — median 7.827 (q25–q75 0.516–14.45)1,928nm — median 7.945 (q25–q75 2.257–16.48)1,943nm — median 5.93 (q25–q75 2.159–13.05)1,959nm — median 5.594 (q25–q75 1.971–11.9)1,974nm — median 5.259 (q25–q75 2.594–9.957)1,990nm — median 5.816 (q25–q75 3.327–9.954)2,005nm — median 6.667 (q25–q75 3.829–11.24)2,021nm — median 7.029 (q25–q75 3.944–11.48)2,036nm — median 7.245 (q25–q75 4.455–11.16)2,051nm — median 7.554 (q25–q75 4.815–11.61)2,067nm — median 7.988 (q25–q75 5.234–11.43)2,082nm — median 8.424 (q25–q75 5.914–11.94)2,098nm — median 8.788 (q25–q75 6.218–12.23)2,113nm — median 9.277 (q25–q75 6.749–12.29)2,129nm — median 9.713 (q25–q75 6.892–12.83)2,144nm — median 10.03 (q25–q75 7.262–13.45)2,160nm — median 10.27 (q25–q75 7.428–13.75)2,175nm — median 10.89 (q25–q75 8.079–14.17)2,191nm — median 11.28 (q25–q75 8.276–14.6)2,206nm — median 11.65 (q25–q75 8.581–15.25)2,222nm — median 11.79 (q25–q75 8.966–15.51)2,237nm — median 11.6 (q25–q75 8.891–15.11)2,253nm — median 10.88 (q25–q75 8.228–14.01)2,268nm — median 9.77 (q25–q75 7.233–12.82)2,283nm — median 9.204 (q25–q75 6.686–12.42)2,299nm — median 8.467 (q25–q75 6.198–11.59)2,314nm — median 7.976 (q25–q75 5.704–11.15)2,330nm — median 7.675 (q25–q75 5.212–10.74)2,345nm — median 7.584 (q25–q75 4.773–10.94)2,361nm — median 7.171 (q25–q75 4.892–10.57)2,376nm — median 6.917 (q25–q75 4.23–10.62)2,392nm — median 6.341 (q25–q75 3.964–9.764)2,407nm — median 5.966 (q25–q75 2.921–10.27)2,423nm — median 6.149 (q25–q75 3.383–10.34)2,438nm — median 5.564 (q25–q75 2.481–10.6)2,454nm — median 5.658 (q25–q75 2.843–11.65)2,469nm — median 5.977 (q25–q75 2.248–15.05)2,485nm — median 7.694 (q25–q75 1.639–19.24)2,500nm — median 7.382 (q25–q75 0.695–20.75)

Sampling

Wavelengths2,151
Axis range350–2,500 nm
Mean spacing1 nm
Griduniform
Observations511

Signal & quality

Value range0 – 5.22e+03
Mean range1.88 – 75.2
Mean level21.94
Area4.716e+04
PTP73.37
Noise RMS0.010896
SNR2e+03
SNR dB7e+01 dB
Dynamic range73.4
Smoothness9.363
Saturated0.0%
X-outliers316

Integrity & artefacts

NaN ratio0.00%
Inf count0
Zero ratio1.79%
Spike count140,566
Spike rate12.80%
Jump count109,480
Jump rate9.96%
Clip fraction1.79%

Shape & reference

Baseline slope-2.7998
Curvature RMS1.3983
D1 RMS1.2153
RMS to mean10.013
RMS p9571.645
SAM to mean0.30132
SAM p951.1006
Affine offset p9513.167
Affine gain p95 Δ0.98787
Affine residual p9570.301
Xcorr lag p9526

Outliers & repeatability

PCA Q p95/median55
Hotelling T2 p95/median51
Mahalanobis H p95/median7.1
Repeat groups0

Dimensionality (PCA)

Effective rank17
PCs → 95% var27
Top-10 cum. var74.3%
Computed metric scores 29worst 1.00
FamilleMétrique calculéeValeurScoreNiveauInterprétation datasetCauses typiquesCalcul / scoring
Intégrité des donnéesNaN ratiointegrity.nan_ratio0%0.00faibleSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countintegrity.inf_count00.00faibleNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratiointegrity.zero_ratio1.79%0.36faibleNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceamplitude.mean_reflectance21.9391.00fortValeur atypique: Trop clair / fond visible ou Trop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveamplitude.area_under_curve471631.00fortValeur atypique: Différence d'éclairement ou NormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)amplitude.peak_to_peak73.3690.00faibleVariabilité forteSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceamplitude.variance1158.30.00faibleNormal ou hétérogèneMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSnoise.noise_rms0.0108960.00faibleStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRnoise.snr2013.50.00faibleBon signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRnoise.bandwise_snr_min1.74220.86fortZone problématiqueDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countartefacts.spike_count140,5661.00fortArtefactsCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateartefacts.spike_rate12.8%1.00fortSpectre suspectInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countartefacts.jump_count109,4801.00fortRaccord détecteurSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateartefacts.jump_rate9.96%1.00fortProblème spectralCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionartefacts.clip_fraction1.79%1.00fortClippingDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopeshape.baseline_slope-2.79980.08faibleStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSshape.curvature_rms1.39831.00fortForme inhabituelleFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSshape.d1_rms1.21530.33faiblePlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)outliers.pca_q_ratio54.7981.00fortSpectre atypiqueArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²outliers.hotelling_t2_ratio50.6861.00fortExtrême mais cohérentVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis Houtliers.mahalanobis_h_ratio7.11931.00fortOutlier globalDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumreference.rms_to_mean_spectrum_p9571.6451.00fortSpectre différentDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)reference.sam_to_mean_spectrum_p951.10061.00fortForme différenteFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDrepeatability.rms_intra_id—0.00faibleStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDrepeatability.sam_intra_id—0.00faibleStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDrepeatability.cv_intra_id—0.00faibleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densitystructure.pca_score_density0.0141321.00fortSous-populationsLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)structure.local_outlier_factor_p9527.921.00fortSpectre isoléCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scorestructure.isolation_forest_score_p950.558121.00fortSpectre atypiqueDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
X PCA score plot-2,50002,5005,0007,50010,000-10,000-5,00005,000PC1 -147.4 · PC2 66.98PC1 -106.4 · PC2 27.77PC1 -116.8 · PC2 32.63PC1 -161 · PC2 92.81PC1 -229.9 · PC2 173.5PC1 -257.5 · PC2 208.8PC1 -116 · PC2 35.49PC1 -74.08 · PC2 -13.02PC1 -121.2 · PC2 49.47PC1 -135.8 · PC2 59.64PC1 -266.6 · PC2 213.6PC1 -266.5 · PC2 216.9PC1 -119.8 · PC2 41.65PC1 -140.7 · PC2 65.5PC1 -85.78 · PC2 0.07603PC1 -143.3 · PC2 67.86PC1 -238.7 · PC2 183.9PC1 -231.7 · PC2 127.1PC1 -171.9 · PC2 22.2PC1 -225.4 · PC2 103.4PC1 -175.9 · PC2 52.56PC1 -276.6 · PC2 187.9PC1 -263 · PC2 175.5PC1 -183.8 · PC2 54.45PC1 -134.8 · PC2 -70.14PC1 -235.8 · PC2 113.7PC1 -160 · PC2 -5.358PC1 -233.8 · PC2 116.5PC1 -160.6 · PC2 -14.36PC1 -209.1 · PC2 54.11PC1 -157.7 · PC2 -2.858PC1 -153.3 · PC2 -50.04PC1 -158.2 · PC2 -9.346PC1 -212.4 · PC2 86.78PC1 -175.7 · PC2 49.5PC1 -148.5 · PC2 -13.59PC1 -165.5 · PC2 7.994PC1 -201.5 · PC2 58.89PC1 -55.02 · PC2 -130.5PC1 -166 · PC2 28.14PC1 -197.7 · PC2 62.06PC1 -126 · PC2 -68.97PC1 -157.3 · PC2 -16.66PC1 -125.2 · PC2 -17.29PC1 -179.9 · PC2 33.68PC1 -226.5 · PC2 92.83PC1 -181 · PC2 9.517PC1 -236.7 · PC2 108.2PC1 -169.4 · PC2 -20.1PC1 -207.3 · PC2 83.18PC1 -222.5 · PC2 95PC1 -181 · PC2 54.29PC1 -169 · PC2 22.81PC1 -154.7 · PC2 25.9PC1 -225.8 · PC2 111.8PC1 -209 · PC2 101.5PC1 -251.4 · PC2 133.7PC1 -195.6 · PC2 47.8PC1 -224.4 · PC2 86.02PC1 -255.5 · PC2 153.6PC1 -183.1 · PC2 8.306PC1 -217.5 · PC2 65.91PC1 -221.2 · PC2 95.71PC1 -188.6 · PC2 41.73PC1 -179.8 · PC2 41.86PC1 -233.6 · PC2 99.98PC1 -219.6 · PC2 94.98PC1 -268.8 · PC2 170.5PC1 -234.7 · PC2 122.8PC1 -185.2 · PC2 11.79PC1 -203.8 · PC2 56.74PC1 -283.3 · PC2 193.4PC1 -244.9 · PC2 141PC1 -179.9 · PC2 3.813PC1 -170.4 · PC2 36.12PC1 -300.1 · PC2 210.9PC1 -229.5 · PC2 99.4PC1 -193.8 · PC2 28.48PC1 -220.9 · PC2 83.12PC1 -193.2 · PC2 43.87PC1 -194.1 · PC2 29.89PC1 -191.6 · PC2 4.642PC1 -186.6 · PC2 43.86PC1 -165.9 · PC2 12.79PC1 -235.1 · PC2 115.8PC1 -178 · PC2 29.28PC1 -196.9 · PC2 46.54PC1 -206.8 · PC2 58.97PC1 -213.1 · PC2 64.28PC1 -244 · PC2 124.4PC1 -207.2 · PC2 52.33PC1 -247.9 · PC2 135.1PC1 -229.9 · PC2 99.37PC1 -214.5 · PC2 66.88PC1 -212.9 · PC2 57.96PC1 -155.6 · PC2 -51.44PC1 -250.4 · PC2 128.9PC1 -241 · PC2 118.6PC1 -220.6 · PC2 77.04PC1 -197.8 · PC2 35.99PC1 -218.8 · PC2 68.24PC1 -201.9 · PC2 35.81PC1 -180.6 · PC2 15.04PC1 -200.6 · PC2 62.88PC1 -192.7 · PC2 42.24PC1 -193.8 · PC2 43.35PC1 -165.1 · PC2 13.6PC1 -182.9 · PC2 -6.191PC1 -191.3 · PC2 47.87PC1 -134.7 · PC2 -19.36PC1 -224.2 · PC2 81.61PC1 -182.2 · PC2 30.71PC1 -189.2 · PC2 15.65PC1 -183.3 · PC2 27.96PC1 -179.4 · PC2 26.18PC1 -170.2 · PC2 15.65PC1 -166.1 · PC2 3.44PC1 -196.8 · PC2 31.24PC1 -208.2 · PC2 63.28PC1 -190 · PC2 63.56PC1 -177.5 · PC2 42.07PC1 -154.9 · PC2 -2.134PC1 -199.3 · PC2 56.33PC1 -183.1 · PC2 22.29PC1 -195.4 · PC2 37.46PC1 -192.8 · PC2 36.44PC1 -137.8 · PC2 -77.05PC1 -176.3 · PC2 59.07PC1 -183.9 · PC2 54.89PC1 -214.5 · PC2 80.48PC1 -223.6 · PC2 109.8PC1 -195 · PC2 39.61PC1 -171.3 · PC2 14.03PC1 -188.4 · PC2 34.81PC1 -186.9 · PC2 50.1PC1 -184.3 · PC2 27.78PC1 -137.2 · PC2 -60.06PC1 -197.2 · PC2 47.59PC1 -154.5 · PC2 -13.51PC1 -148.1 · PC2 -59.54PC1 -162.2 · PC2 16.01PC1 -179.6 · PC2 16.49PC1 -150.6 · PC2 -16.93PC1 -126.8 · PC2 -43.29PC1 -265.3 · PC2 157.6PC1 -151.8 · PC2 -20.48PC1 -173.9 · PC2 82.92PC1 -10.42 · PC2 -148PC1 -104.7 · PC2 62.24PC1 -67.79 · PC2 17.55PC1 -101.1 · PC2 100.3PC1 -215.6 · PC2 101.6PC1 -91.21 · PC2 -27.11PC1 -62.11 · PC2 -3.966PC1 -127.7 · PC2 -2.342PC1 -146.2 · PC2 1.871PC1 -275.6 · PC2 239.8PC1 -234.3 · PC2 107.2PC1 -234.3 · PC2 107.2PC1 -216.6 · PC2 72.97PC1 -234.3 · PC2 95.84PC1 -234.3 · PC2 95.84PC1 -221.2 · PC2 66.99PC1 -234.4 · PC2 98.06PC1 -223.4 · PC2 72.61PC1 -221.3 · PC2 70.43PC1 -230.3 · PC2 84.13PC1 -211.5 · PC2 50.78PC1 -231.4 · PC2 87.63PC1 -141.2 · PC2 28.51PC1 -74.68 · PC2 34.77PC1 -130.1 · PC2 60.55PC1 59.32 · PC2 -130PC1 -253.6 · PC2 142.2PC1 -253.6 · PC2 142.2PC1 -253.6 · PC2 142.2PC1 -253.6 · PC2 142.2PC1 -157.5 · PC2 -42.72PC1 -204.2 · PC2 33.25PC1 -216.5 · PC2 58.93PC1 -243.4 · PC2 126.2PC1 -197.9 · PC2 79.06PC1 -201.1 · PC2 61.63PC1 -198.9 · PC2 76.21PC1 -258.1 · PC2 136.8PC1 -219.6 · PC2 64.37PC1 -217.8 · PC2 67.17PC1 -174.9 · PC2 -17.43PC1 -175.9 · PC2 -15.07PC1 -137.9 · PC2 -55.06PC1 -167.3 · PC2 -10.51PC1 -133.3 · PC2 8.238PC1 -9.645 · PC2 -1.518PC1 -189.2 · PC2 -5.029PC1 -108.2 · PC2 5.921PC1 -70.21 · PC2 34.71PC1 -182.4 · PC2 13.26PC1 -195.4 · PC2 42.43PC1 -130.5 · PC2 9.731PC1 -223.6 · PC2 66.57PC1 -166.3 · PC2 18.37PC1 -58.03 · PC2 27.66PC1 -135.2 · PC2 15.59PC1 -198.4 · PC2 39.62PC1 -117.2 · PC2 5.969PC1 -64.47 · PC2 -13.61PC1 -164.1 · PC2 79.05PC1 -68.65 · PC2 -20.64PC1 -131.8 · PC2 65.19PC1 -168.3 · PC2 38.24PC1 -166.2 · PC2 25.14PC1 -167.8 · PC2 24.72PC1 -196.7 · PC2 142.4PC1 -143.5 · PC2 27.51PC1 -220.7 · PC2 56.16PC1 -205.3 · PC2 99.28PC1 -198.4 · PC2 27.18PC1 -181.6 · PC2 16.6PC1 -183.6 · PC2 71.02PC1 -178.2 · PC2 59.59PC1 -180.8 · PC2 63.45PC1 -100.8 · PC2 35.4PC1 -129.6 · PC2 23.69PC1 -160.1 · PC2 32.31PC1 -241.7 · PC2 172.8PC1 -234.8 · PC2 121.9PC1 -206.7 · PC2 80.08PC1 -230.9 · PC2 126.4PC1 -237.8 · PC2 107.2PC1 -152 · PC2 -9.937PC1 -166 · PC2 13.52PC1 -296.1 · PC2 207.3PC1 -177.5 · PC2 -48.66PC1 -179.1 · PC2 1.457PC1 -183.7 · PC2 -167.4PC1 -177.7 · PC2 39.38PC1 -210 · PC2 58.91PC1 -137 · PC2 -220.6PC1 -182.5 · PC2 39.53PC1 -224 · PC2 75.03PC1 -216.3 · PC2 -10.88PC1 -179.8 · PC2 7.981PC1 -237.3 · PC2 -17.8PC1 -145.2 · PC2 -180.3PC1 -173.4 · PC2 -99.95PC1 -193.6 · PC2 29.6PC1 -220.1 · PC2 -242.4PC1 -157 · PC2 -5.583PC1 -159.2 · PC2 -95.61PC1 -169.2 · PC2 1.25PC1 -158.6 · PC2 -33.53PC1 -164.8 · PC2 -27.05PC1 -150.5 · PC2 -126.5PC1 -131.1 · PC2 -73.95PC1 -232.7 · PC2 88.03PC1 -193.3 · PC2 24.14PC1 -245.9 · PC2 141.6PC1 -217.9 · PC2 97.8PC1 -231 · PC2 96.7PC1 -207.6 · PC2 80.25PC1 -212.6 · PC2 83.62PC1 -225.3 · PC2 86.68PC1 -230.2 · PC2 90.72PC1 -235.1 · PC2 112.2PC1 -235.8 · PC2 100.8PC1 -234.6 · PC2 96.77PC1 -235.5 · PC2 104.5PC1 -288.2 · PC2 210.3PC1 -251.1 · PC2 135.5PC1 -207.4 · PC2 57.57PC1 -229.2 · PC2 114PC1 -237.8 · PC2 110.3PC1 -270.2 · PC2 183PC1 -289.7 · PC2 196.8PC1 -270 · PC2 158PC1 -194.7 · PC2 32.83PC1 -197.8 · PC2 118.5PC1 -247 · PC2 118.6PC1 -208.8 · PC2 94.36PC1 -238.5 · PC2 123.1PC1 -249.4 · PC2 134.6PC1 -189.3 · PC2 86.93PC1 -247.5 · PC2 116.8PC1 -251.2 · PC2 145.1PC1 -267.5 · PC2 166.3PC1 -235.9 · PC2 108.7PC1 -168.4 · PC2 94.31PC1 -226.8 · PC2 73.39PC1 -232.6 · PC2 107.4PC1 -212.9 · PC2 54.02PC1 226.2 · PC2 -403.7PC1 -87.67 · PC2 -76.96PC1 -213.9 · PC2 77.43PC1 -135.5 · PC2 -13.83PC1 -189.6 · PC2 66.18PC1 -46.96 · PC2 -130.5PC1 -240.3 · PC2 160.9PC1 -206.6 · PC2 59.87PC1 -68.89 · PC2 -13.44PC1 -149 · PC2 -35.61PC1 -177.4 · PC2 69.07PC1 -115.6 · PC2 22.14PC1 -36.61 · PC2 -168.7PC1 -143.9 · PC2 -15.4PC1 -76.91 · PC2 -47.68PC1 -154.6 · PC2 26.07PC1 -75.4 · PC2 -17.26PC1 -178.4 · PC2 74.28PC1 51.21 · PC2 -244.2PC1 0.5903 · PC2 -117.5PC1 -217.1 · PC2 147.5PC1 -191.3 · PC2 116.2PC1 -61.91 · PC2 -42.49PC1 -10.46 · PC2 -175.4PC1 -0.587 · PC2 -93.11PC1 -239.6 · PC2 159.4PC1 -178.2 · PC2 46.38PC1 -200.8 · PC2 57.47PC1 -220.6 · PC2 88.52PC1 -194 · PC2 64.64PC1 -156.8 · PC2 23.49PC1 -187.5 · PC2 40.43PC1 -218.4 · PC2 103.3PC1 -153.9 · PC2 32.99PC1 -175.3 · PC2 43.9PC1 -146.8 · PC2 -7.645PC1 -181.9 · PC2 31.21PC1 -177.8 · PC2 53.7PC1 -216.3 · PC2 91.89PC1 -208.8 · PC2 85.39PC1 -59.57 · PC2 -123.2PC1 -221.6 · PC2 87.99PC1 -205.2 · PC2 67.57PC1 -216.9 · PC2 102.7PC1 -244.5 · PC2 132.9PC1 -227.9 · PC2 110PC1 -204.4 · PC2 90.27PC1 -221.9 · PC2 88.89PC1 -206.2 · PC2 84.41PC1 -261.4 · PC2 151.9PC1 -282.7 · PC2 193.7PC1 -234.9 · PC2 118.1PC1 -227.6 · PC2 93.23PC1 -273.3 · PC2 173.5PC1 -194.7 · PC2 31.35PC1 -218.8 · PC2 71.13PC1 -273.1 · PC2 167.7PC1 -294.1 · PC2 217.5PC1 -284.3 · PC2 198PC1 -247.7 · PC2 123.4PC1 -224.5 · PC2 98.74PC1 -238.4 · PC2 112.2PC1 -243.5 · PC2 111.9PC1 -251.9 · PC2 134.1PC1 -265 · PC2 150.7PC1 -244.3 · PC2 123.5PC1 -269.9 · PC2 164.2PC1 -298.2 · PC2 213PC1 -259.8 · PC2 142.8PC1 -253.3 · PC2 134.8PC1 -268.5 · PC2 154.8PC1 -296.6 · PC2 211.6PC1 -262.9 · PC2 161.3PC1 -23.17 · PC2 -37.52PC1 33.71 · PC2 -52.63PC1 530.3 · PC2 -646.8PC1 905.6 · PC2 -774.3PC1 527.7 · PC2 -74.42PC1 -153.7 · PC2 49.46PC1 -67.79 · PC2 55.9PC1 147.3 · PC2 104PC1 64.7 · PC2 -130.9PC1 34.2 · PC2 -88.81PC1 1530 · PC2 -3152PC1 2749 · PC2 -6451PC1 147.9 · PC2 -499.5PC1 435.5 · PC2 -855.7PC1 361.5 · PC2 -128.7PC1 1970 · PC2 -1872PC1 8953 · PC2 4428PC1 1402 · PC2 -1063PC1 2162 · PC2 780.4PC1 1289 · PC2 -494.5PC1 1252 · PC2 -618.4PC1 3918 · PC2 -584.7PC1 438.7 · PC2 -594.4PC1 1531 · PC2 -1346PC1 2542 · PC2 253.6PC1 5515 · PC2 1770PC1 2637 · PC2 -391PC1 2003 · PC2 -142.6PC1 1957 · PC2 -1476PC1 570.4 · PC2 -549.2PC1 1330 · PC2 -211.8PC1 2237 · PC2 -1189PC1 2579 · PC2 -933.8PC1 2369 · PC2 566.6PC1 366.6 · PC2 -179.8PC1 -132.6 · PC2 -10.09PC1 128.6 · PC2 22.21PC1 17.59 · PC2 68.32PC1 -128.4 · PC2 91.67PC1 -33.4 · PC2 -66.06PC1 -142.8 · PC2 29.6PC1 310.4 · PC2 -123.9PC1 -133.5 · PC2 140.9PC1 -147.2 · PC2 -19.61PC1 -117.3 · PC2 66.65PC1 -187.2 · PC2 46.32PC1 -160.7 · PC2 33.94PC1 -162.3 · PC2 82.19PC1 47.26 · PC2 5.41PC1 -184.8 · PC2 138.1PC1 216.7 · PC2 27.69PC1 -149.7 · PC2 74.26PC1 -184.7 · PC2 -28.95PC1 -207.4 · PC2 90.77PC1 225.8 · PC2 -76.65PC1 -38.8 · PC2 -23.24PC1 -202.1 · PC2 122.1PC1 56.34 · PC2 -133.4PC1 -200.3 · PC2 86.74PC1 295.6 · PC2 -169.5PC1 -176.7 · PC2 50.12PC1 -229.1 · PC2 101.7PC1 43.9 · PC2 -72.64PC1 -174.2 · PC2 36.06PC1 146.1 · PC2 -165.7PC1 238.5 · PC2 -252.3PC1 -127.5 · PC2 -89.03PC1 -62.87 · PC2 -20.25PC1 448 · PC2 -386.2PC1 -195.7 · PC2 72.18PC1 -137.9 · PC2 15.64PC1 -178.3 · PC2 42.34PC1 698.3 · PC2 -373.9PC1 172.5 · PC2 -76.55PC1 209.3 · PC2 -102.8PC1 19.52 · PC2 -86.2PC1 178 · PC2 -94.37PC1 -125.8 · PC2 -27.64PC1 384.8 · PC2 -38.35PC1 -223.4 · PC2 77.24PC1 -9.797 · PC2 -11.72PC1 42.57 · PC2 62.12PC1 -126.7 · PC2 92.78PC1 -46.76 · PC2 -25.03PC1 -165.8 · PC2 69.24PC1 -100.4 · PC2 75.37PC1 -0.06995 · PC2 -64.58PC1 9.049 · PC2 123.4PC1 -86.42 · PC2 30.88PC1 -67.29 · PC2 50.47PC1 -111.6 · PC2 29.78PC1 -21.29 · PC2 95.42PC1 -52.9 · PC2 55.11PC1 -35.33 · PC2 66.33PC1 -95.98 · PC2 25.4PC1 -44.32 · PC2 -17.15PC1 -95.12 · PC2 -31.91PC1 -2.058 · PC2 83.68PC1 -60.64 · PC2 44.57PC1 45.67 · PC2 -136PC1 -185.8 · PC2 54.97PC1 -34.24 · PC2 -31.9PC1 -22.68 · PC2 -53.63PC1 -70.9 · PC2 116.6PC1 -87.08 · PC2 120.1PC1 -52.43 · PC2 84.42PC1 -109.5 · PC2 30.32PC1 -200.4 · PC2 65.14PC1 -46.54 · PC2 -35.69PC1 78.83 · PC2 -99.91PC1 -133.1 · PC2 -213.8PC1 220.8 · PC2 -20.19PC1 -3.438 · PC2 -67.42PC1 39.36 · PC2 -72.89PC1 282.7 · PC2 -148.2PC1 223.3 · PC2 -210.5PC1 1384 · PC2 -464.2PC1 1153 · PC2 37.66PC1 940.6 · PC2 -322.1PC1 1606 · PC2 152.9PC1 2426 · PC2 675.5PC1 1160 · PC2 346.5PC1 732.9 · PC2 125.6PC1 -48.7 · PC2 116.6PC1 2355 · PC2 -8.686PC1 211.2 · PC2 -144.4PC1 199.9 · PC2 153.2PC1 2845 · PC2 -391.5PC1 36.9 · PC2 -131.8PC1 3.352 · PC2 -125.8PC1 284.1 · PC2 -1301PC1 438.6 · PC2 -1530PC1 202.5 · PC2 -290.8PC1 1373 · PC2 112.5PC1 803.4 · PC2 -779.8PC1 -163.3 · PC2 90.78PC1 -225.2 · PC2 161.5PC1 -215.4 · PC2 130.8PC1 -164.5 · PC2 117.1PC1 -184.8 · PC2 106.4PC1 -237.9 · PC2 187.5PC1 -185.9 · PC2 97.8PC1 -147.9 · PC2 114PC1 -224 · PC2 136.6PC1 -233.1 · PC2 175.1PC1 -212.1 · PC2 135PC1 -245.9 · PC2 194PC1 -184.4 · PC2 99.83PC1 (22.8%)PC2 (9.4%)511 scores
PCA explained variance0%25%50%75%100%PC1: 22.8% (cumulative 22.8%)1PC2: 9.4% (cumulative 32.2%)2PC3: 7.5% (cumulative 39.7%)3PC4: 7.0% (cumulative 46.7%)4PC5: 6.4% (cumulative 53.0%)5PC6: 5.8% (cumulative 58.8%)6PC7: 5.0% (cumulative 63.8%)7PC8: 4.0% (cumulative 67.7%)8PC9: 3.8% (cumulative 71.5%)9PC10: 2.8% (cumulative 74.3%)10cumulative explained variancePC variancecumulativeprincipal component · cumulative (dashed)

Metric interpretation reference

Metric catalog 29
FamilleMétriqueCe qu’elle détecteForte valeur =Faible valeur =Causes typiquesCalcul / score
Intégrité des donnéesNaN ratioDonnées manquantesSpectre corrompuSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countValeurs infiniesCorruptionNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratioColonnes ou cellules nullesSpectre tronquéNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceNiveau moyenTrop clair / fond visibleTrop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveIntensité globaleDifférence d'éclairementNormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)DynamiqueVariabilité forteSpectre platSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceVariabilité spectraleNormal ou hétérogèneSpectre platMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSBruit haute fréquenceBruitéStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRQualité signalBon signalMauvais signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRBruit localiséZone fiableZone problématiqueDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countPics étroitsArtefactsSpectre propreCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateDensité de picsSpectre suspectNormalInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countDiscontinuitésRaccord détecteurContinuSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateFréquence de sautsProblème spectralNormalCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionSaturationClippingNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopePente globaleDériveStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSCourbureForme inhabituelleLisseFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSVariabilité localeSpectre structuréPlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)Non expliqué par PCASpectre atypiqueConformeArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²Extrême dans PCAExtrême mais cohérentCentralVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis HDistance au nuageOutlier globalPopulation normaleDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumDistance moyenneSpectre différentTypiqueDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)Différence de formeForme différenteSimilaireFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDReproductibilitéMauvaise répétabilitéStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDVariation de formeInstableStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDVariabilité interneMauvais contrôleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densityClustersSous-populationsHomogèneLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)Anomalie localeSpectre isoléPopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scoreAnomalie globaleSpectre atypiqueNormalDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
Technology-specific extensions
TechnologieAdaptations / métriquesAnomalies cibléesCommentaire pratique
UV-Vis 300-1000 nmBaseline, pente globale, dérive aux bords 300-350 et 900-1000; métriques par zonesLumière parasite, mauvais blanc, saturation, faible signal aux extrémitésLes bords sont souvent instables; calculer aussi des scores edge/middle.
UV-Vis 300-1000 nmSaturation / clipping proche absorbance max ou réflectance maxSignal écrêtéTrès important si absorption forte.
UV-Vis 300-1000 nmRed-edge, position de maximum, ratios de bandes si végétalDécalage biologique ou artefact optiqueAide à distinguer changement réel et problème d'acquisition.
UV-Vis 300-1000 nmSmoothness / roughness indexBruit haute fréquenceSouvent plus informatif que le SNR seul.
MIR / ATR-FTIRATR contact quality index: intensité globale, aire totale, profondeur des bandes clésMauvais contact cristal-échantillonCrucial: beaucoup d'anomalies viennent du contact ATR.
MIR / ATR-FTIRCO2 / H2O atmospheric bandsMauvaise correction atmosphériquePics parasites fréquents.
MIR / ATR-FTIRBaseline curvature / rubber-band residualDiffusion, contact, dérive baselineTrès utile avant PCA.
MIR / ATR-FTIRPeak position shiftMauvais alignement spectral / calibrationImportant en FTIR car de petits shifts comptent.
MIR / ATR-FTIRBand area ratios sur bandes connuesSpectre chimiquement incohérentÀ adapter par matrice: polysaccharides, protéines, lipides, etc.
HS-MSTotal Ion Current (TIC), Base Peak Intensity (BPI)Injection faible, ionisation instableÉquivalent MS du niveau global spectral.
HS-MSNombre de pics détectésSpectre pauvre ou trop bruitéTrop peu = mauvais signal; trop = bruit/contamination.
HS-MSMass accuracy / m/z driftProblème calibration masseFondamental en HRMS.
HS-MSRetention time drift si LC/GC-MSDérive chromatographiqueÀ suivre sur standards/QC pools.
HS-MSBlank contamination scoreContaminants / carry-overComparer échantillons vs blancs.
HS-MSInternal standard CVVariabilité instrumentaleTrès robuste si standards disponibles.
HS-MSMissingness par featureInstabilité de détectionCrucial pour filtrer les variables.
Avec répétitionsRMS intra-échantillonRépétabilité globaleApplicable à toutes les technologies.
Avec répétitionsSAM / corrélation intra-échantillonRépétabilité de formeTrès utile pour spectres.
Avec répétitionsCV intra-échantillon par bande / featureRépétabilité localeDétecte les zones instables.
Avec répétitionsICC ou variance componentsPart variance échantillon vs techniqueTrès utile si plusieurs répétitions par sample.
Avec répétitionsDistance au centroïde intra-IDRépétition aberrantePermet de flagger la mauvaise répétition plutôt que le sample entier.
Bug-hunting / supervised audits
Famille de bug potentielMéthodes à ajouterCe que ça détecteÉtat dans l’explorateur
Shift spectral globalCorrélation spectre moyen inter-dataset, DTW, cross-correlation, comparaison positions de picsDécalage en longueur d'onde, mauvais alignement, interpolation différentePartiellement calculé: cross-correlation lag et dispersion des positions de pics vs spectre moyen.
Baseline / offset / gainRégression chaque spectre vs spectre moyen: x = a + b ref + residual; suivi de a, b, RMS résiduelOffset additif, effet multiplicatif, dérive de baselineCalculé dans reference.affine_*.
Mélange de lignes / mauvais appariement X-M-YVérification index, hash des lignes, duplication ID, distance spectrale intra-ID, labels incohérentsLignes mélangées, metadata mal alignées, Y attribué au mauvais spectrePartiellement couvert par répétabilité intra-ID; checks index/hash à ajouter au pipeline canonical.
Fuite d'information / répétitions mal splitéesGroupKFold par sample_id vs StratifiedKFold random; audit des partitions par sample_idPerformance artificiellement bonne due aux répétitionsNécessite splits et benchmark modèle; non calculé par la carte descriptive.
Label bugsÉchantillons proches en X mais Y différents, confident learning, erreurs systématiques FP/FNY inversés, erreurs de saisie, classes ambiguësNécessite Y et/ou modèle; recommandé pour l'explorateur supervisé.
Sous-domaines cachésPCA/UMAP/t-SNE + clustering non supervisé + association avec dataset/Y/date/operatorLots, campagnes, sondes, backgrounds non renseignésPartiellement calculé par structure PCA/LOF; UMAP/t-SNE hors carte statique.
Artefacts localisés inconnusCarte wavelength x dataset: différence moyenne, différence variance, KS par longueur d'ondeRégions spectrales anormales non anticipéesÀ calculer au niveau banque quand plusieurs datasets partagent un axe spectral.
Ruptures instrumentalesDiscontinuités dans dérivées, changepoint detectionSplice, raccord détecteur, saut local non prévuCalculé par jump/spike rates; changepoint plus avancé à ajouter.
Mélange / contamination spectraleNMF / unmixing / reconstruction par convex hullComposante externe: fond, plastique, solNon calculé automatiquement; nécessite hypothèses de composants ou grande bibliothèque.
Features instables mais prédictivesImportance modèle vs instabilité QC par variableModèle qui apprend un artefact plutôt qu'un signal biologiqueNécessite modèle supervisé; recommandé pour rapports de benchmark.

Variables

Targets 2

Spectra_Group

target · categorical
Spectra_Group classesNGEEArctic_Council_Transect01…NGEEArctic_Council_Transect01_8deg_Refl: 3232NGEEArctic_Council_Transect02…NGEEArctic_Council_Transect02_8deg_Refl: 2828NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_13_8deg_Refl: 2727NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_6_8deg_Refl: 2626NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_12_8deg_Refl: 2626NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_14_8deg_Refl: 2525NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_8_8deg_Refl: 2424NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_10_8deg_Refl: 2424NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_3_8deg_Refl: 2323NGEEArctic_Teller_Spectra_Tra…NGEEArctic_Teller_Spectra_Transect_7_8deg_Refl: 2323+10 more+10 more: 179179
n / missing511 / 1
Classes74
Balance (entropy)0.81
Imbalance ratio32
Top classNGEEArctic_Council_Transect01_8deg_Refl (32)

Target_Type

target · categorical
Target_Type classesVegetationVegetation: 479479Road/gravelRoad/gravel: 3030WaterWater: 11
n / missing511 / 1
Classes3
Balance (entropy)0.22
Imbalance ratio479
Top classVegetation (479)

Metadata 4

site

metadata · categorical
site classesSeward_TellerSeward_Teller: 366366Seward_CouncilSeward_Council: 7777Seward_KougarokSeward_Kougarok: 6767
n / missing511 / 1
Classes3
Balance (entropy)0.72
Imbalance ratio5
Top classSeward_Teller (366)

latitude

metadata · numeric
latitude distribution020040064.73 – 64.75: 36664.75 – 64.76: 064.76 – 64.78: 064.78 – 64.8: 064.8 – 64.82: 064.82 – 64.84: 064.84 – 64.86: 064.86 – 64.87: 7764.87 – 64.89: 064.89 – 64.91: 064.91 – 64.93: 064.93 – 64.95: 064.95 – 64.97: 064.97 – 64.98: 064.98 – 65: 065 – 65.02: 065.02 – 65.04: 065.04 – 65.06: 065.06 – 65.08: 065.08 – 65.09: 065.09 – 65.11: 065.11 – 65.13: 065.13 – 65.15: 065.15 – 65.17: 6764.664.865.065.2
n / missing511 / 1
Mean ± SD64.81 ± 0.147
Median64.73
Range64.73 – 65.17
CV0.00227
Skew / kurtosis1.8 / 1.8
Normal?no

longitude

metadata · numeric
longitude distribution0200400-165.9 – -165.9: 366-165.9 – -165.8: 0-165.8 – -165.7: 0-165.7 – -165.6: 0-165.6 – -165.5: 0-165.5 – -165.4: 0-165.4 – -165.3: 0-165.3 – -165.2: 0-165.2 – -165.1: 0-165.1 – -165: 0-165 – -164.9: 0-164.9 – -164.8: 0-164.8 – -164.7: 67-164.7 – -164.6: 0-164.6 – -164.5: 0-164.5 – -164.4: 0-164.4 – -164.4: 0-164.4 – -164.3: 0-164.3 – -164.2: 0-164.2 – -164.1: 0-164.1 – -164: 0-164 – -163.9: 0-163.9 – -163.8: 0-163.8 – -163.7: 77-166-165-164-163
n / missing511 / 1
Mean ± SD-165.5 ± 0.833
Median-165.9
Range-165.9 – -163.7
CV0.00503
Skew / kurtosis1.4 / 0.17
Normal?no

date

metadata · categorical
date classes20170730.020170730.0: 21821820170804.020170804.0: 13513520170807.020170807.0: 777720170803.020170803.0: 676720170805.020170805.0: 1313
n / missing511 / 1
Classes5
Balance (entropy)0.85
Imbalance ratio2e+01
Top class20170730.0 (218)
Constant metadata 17
  • ecosis_resource_id786ab19f-ae0b-4d80-ab93-3bc6c8610aae
  • coordinate_precision_notessource-provided coordinates when available
  • year2,017
  • plant_partNPV, Canopy, Rock, Soil, Water
  • canopy_or_leafcanopy
  • instrumentSpectra Vista Corporation HR-1024i
  • acquisition_modeProximal
  • signal_typereflectance
  • axis_unitnm
  • axis_min350
  • axis_max2,500
  • n_points_original2,151
  • citationShawn P. Serbin Daryl Yang Ran Meng Andrew McMahon Wouter Hantson Daniel Hayes Kim Ely. 2017. NGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska. Data set. Available on-line [http://ecosis.org] from the Ecological Spectral Information System (EcoSIS)
  • licenseCreative Commons Attribution
  • rights_statusexplicit_open
  • usage_scopepublic_reuse_possible
  • notesEcoSIS package ngee-arctic-2017-canopy-spectral-reflectance-seward-peninsula-alaska, no interpolation applied by project.

6 variable(s) omitted (no recorded values).

Alignment

Alignment levelobservation
Sample id availableyes
Samples511
Observations (total)511
Reps per samplemin 1 · mean 1 · max 1

Provenance & citation

ContributorNGEE Arctic 2017 Canopy Spectral Reflectance Seward Peninsula Alaska
Origin · url [open]https://data.ecosis.org/dataset/ngee-arctic-2017-canopy-spectral-reflectance-seward-peninsula-alaska
Origin · script [manual]source_to_standard.py — standardization script (maintainer-only)

Governance & integrity

Tierpublic
LicenseCC-BY-4.0
Permitted useResearch and benchmarking.
Access policyOpen per source license.
RedistributionEcoSIS CKAN metadata exposes an open license.
Content version1.0.0
Schema / protocol2.0
Content hasheab6412bac11568d…
Processing hash37317ba664481981…
Metadata hashfe7d3cf5c79ef0ae…

Load this dataset

# pip install nirs4all-datasets
from nirs4all_datasets import get

ds = get("ecosis_ngee_arctic_2017_canopy_spectral_reflectance_seward_pen_reflectance_nirs")            # DOI-pinned, checksum-verified, cached
X, y = ds.x(), ds.y()
print(X.shape, y.shape)
card.jsoncroissant.jsonIdentity metadata only — the dataset bytes live at the origin / DOI.