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Private

ECOSTRESS vegetation tir axis d3f7b526

ecostress · other

ECOSTRESS vegetation tir axis d3f7b526. v2.0 standardized NIRS package: 1 spectral source(s), 1 declared target(s). Auto-generated from dataset_card.json (verify before publication).

nirv2ecostress
🔒
Private dataset. Full metadata and metrics are shown, but the bytes are not redistributed here — exporting the data requires a Dataverse token. The identity card carries no spectra, only descriptive statistics.
4
samples
1,736
wavelengths
1
sources
1
targets
27
metadata
other
family

Dataset property explorer

Mean profile risk0.39
Highest axisArtefacts locaux · 1.00
Diagnostics8
Sources profiled1
ECOSTRESS vegetation tir axis d3f7b526 property profile0.250.50.751integritynoiseartefactsbaselinePCA outliersreferencerepeatabilitystructureECOSTRESS vegetation tir axis d3f7b526 profileintegrity: 0.00noise: 0.14artefacts: 1.00baseline: 0.55PCA outliers: 0.50reference: 0.54repeatability: 0.00structure: 0.40ECOSTRESS veget…0 center · 1 outer ring · outward = stronger anomaly / heterogeneity signal

Profile axes

Intégrité0.00
Artefacts locaux1.00
Bruit0.14
Outliers PCA0.50
Distance à la référence0.54
Répétabilité0.00
Baseline / forme0.55
Structure multi-régimes0.40
Diagnostic hypotheses00.250.50.751hypothesis scoreSplice / raccord détecteursSplice / raccord détecteurs: 0.620.62Erreur interpolation / réécha…Erreur interpolation / rééchantillonnage: 0.530.53Erreur calibration / référenc…Erreur calibration / référence blanche: 0.480.48Signature VERA25-likeSignature VERA25-like: 0.460.46Fond différentFond différent: 0.400.40Différence de sonde / géométr…Différence de sonde / géométrie: 0.390.39Spectre très bruitéSpectre très bruité: 0.350.35Dataset multi-régimesDataset multi-régimes: 0.310.31
DiagnosticScoreForceSignauxInterprétation probable
Splice / raccord détecteursX0.62moyenneSpike rate 1.00, SNR non dégradé 0.58, Jump rate 0.56Rupture aux jonctions de détecteurs, calibration locale ou sonde différente.
Erreur interpolation / rééchantillonnageX0.53moyenneSpike rate 1.00, Noise RMS faible 0.86, SNR normal/élevé 0.58Artefacts numériques ou traitement spectral incorrect.
Erreur calibration / référence blancheX0.48moyenneartefacts locaux 1.00, Baseline/mean/area 0.55, RMS/SAM référence 0.54Décalage systématique entre campagnes, instruments ou référence blanche.
Signature VERA25-likeX0.46moyenneSpike rate 1.00, Jump rate 0.56, RMS/SAM référence 0.54Combinaison possible changement de sonde + splice, amplifiée par géométrie, fond ou calibration.
Fond différentX0.40faibleBaseline/mean/area 0.55, RMS/SAM référence 0.54, PCA Q 0.50Effet systématique du support, blanc/noir, transflectance ou environnement de mesure.
Différence de sonde / géométrieX0.39faibleBaseline/mean/area 0.55, RMS/SAM référence 0.54, PCA Q 0.50Modification de l'illumination, collecte, angle ou distance sonde-échantillon.
Spectre très bruitéX0.35faibleSpike rate 1.00, RMS/SAM référence 0.54, PCA Q 0.50Faible signal, problème détecteur, lampe ou acquisition instable.
Dataset multi-régimesX0.31faibleRMS/SAM référence 0.54, PCA Q 0.50, Structure PCA 0.40Mélange de campagnes, opérateurs, lots, setups ou sous-populations spectrales.

Spectral sources

vegetation tir

X · other · source instruments vary by sample
vegetation tir spectra0246805101520q05-q95 envelopeq25-q75 envelopemedian spectrummedianq25–q75q05–q95wavelength / none2.501none — median 5.398 (q25–q75 5.189–5.743)2.516none — median 5.282 (q25–q75 5.052–5.645)2.532none — median 5.294 (q25–q75 5.044–5.592)2.547none — median 5.25 (q25–q75 5.091–5.506)2.563none — median 5.199 (q25–q75 4.898–5.645)2.579none — median 5.315 (q25–q75 5.03–5.632)2.595none — median 5.048 (q25–q75 4.743–5.446)2.611none — median 4.941 (q25–q75 4.675–5.121)2.628none — median 4.566 (q25–q75 4.301–4.727)2.644none — median 4.204 (q25–q75 3.981–4.286)2.662none — median 3.644 (q25–q75 3.412–3.851)2.678none — median 3.255 (q25–q75 2.987–3.567)2.697none — median 2.952 (q25–q75 2.574–3.333)2.713none — median 2.655 (q25–q75 2.262–3.037)2.732none — median 2.48 (q25–q75 2.088–2.843)2.749none — median 2.405 (q25–q75 1.933–2.818)2.769none — median 2.224 (q25–q75 1.826–2.624)2.786none — median 2.117 (q25–q75 1.734–2.549)2.806none — median 2.044 (q25–q75 1.631–2.475)2.824none — median 1.954 (q25–q75 1.5–2.425)2.844none — median 1.91 (q25–q75 1.487–2.307)2.863none — median 1.809 (q25–q75 1.359–2.261)2.884none — median 1.739 (q25–q75 1.309–2.179)2.903none — median 1.575 (q25–q75 1.174–2.014)2.925none — median 1.599 (q25–q75 1.27–1.959)2.945none — median 1.584 (q25–q75 1.218–1.942)2.967none — median 1.628 (q25–q75 1.263–1.952)2.987none — median 1.58 (q25–q75 1.289–1.866)3.008none — median 1.608 (q25–q75 1.288–1.938)3.031none — median 1.691 (q25–q75 1.289–2.047)3.052none — median 1.647 (q25–q75 1.368–1.942)3.076none — median 1.746 (q25–q75 1.39–2.078)3.098none — median 1.784 (q25–q75 1.457–2.06)3.122none — median 1.89 (q25–q75 1.571–2.143)3.145none — median 1.91 (q25–q75 1.59–2.13)3.17none — median 2.021 (q25–q75 1.702–2.23)3.193none — median 2.02 (q25–q75 1.704–2.27)3.219none — median 2.093 (q25–q75 1.79–2.298)3.243none — median 2.08 (q25–q75 1.782–2.308)3.27none — median 2.116 (q25–q75 1.833–2.305)3.294none — median 2.118 (q25–q75 1.842–2.308)3.322none — median 2.141 (q25–q75 1.865–2.313)3.348none — median 2.128 (q25–q75 1.864–2.315)3.376none — median 2.11 (q25–q75 1.918–2.274)3.403none — median 2.327 (q25–q75 2.098–2.53)3.432none — median 3.213 (q25–q75 2.725–3.715)3.459none — median 2.634 (q25–q75 2.253–2.953)3.49none — median 2.456 (q25–q75 2.144–2.731)3.518none — median 2.972 (q25–q75 2.565–3.4)3.549none — median 2.779 (q25–q75 2.483–3.091)3.579none — median 2.806 (q25–q75 2.56–3.095)3.611none — median 2.98 (q25–q75 2.789–3.191)3.641none — median 3.135 (q25–q75 3.008–3.244)3.675none — median 3.299 (q25–q75 3.168–3.365)3.707none — median 3.461 (q25–q75 3.305–3.562)3.741none — median 3.597 (q25–q75 3.434–3.707)3.774none — median 3.762 (q25–q75 3.545–3.922)3.807none — median 3.834 (q25–q75 3.62–4.037)3.844none — median 3.911 (q25–q75 3.728–4.08)3.878none — median 3.884 (q25–q75 3.732–4.049)3.917none — median 3.883 (q25–q75 3.742–4.049)3.952none — median 3.821 (q25–q75 3.692–3.957)3.992none — median 3.792 (q25–q75 3.62–3.933)4.029none — median 3.718 (q25–q75 3.578–3.852)4.07none — median 3.631 (q25–q75 3.512–3.731)4.109none — median 3.6 (q25–q75 3.492–3.665)4.152none — median 3.49 (q25–q75 3.384–3.557)4.192none — median 3.434 (q25–q75 3.335–3.481)4.236none — median 3.622 (q25–q75 3.482–3.732)4.278none — median 3.497 (q25–q75 3.386–3.549)4.325none — median 3.255 (q25–q75 3.132–3.314)4.369none — median 3.021 (q25–q75 2.906–3.125)4.417none — median 2.944 (q25–q75 2.811–3.04)4.463none — median 2.843 (q25–q75 2.721–2.953)4.513none — median 2.782 (q25–q75 2.662–2.882)4.561none — median 2.719 (q25–q75 2.571–2.839)4.613none — median 2.685 (q25–q75 2.548–2.813)4.663none — median 2.642 (q25–q75 2.456–2.826)4.718none — median 2.607 (q25–q75 2.468–2.748)4.77none — median 2.643 (q25–q75 2.545–2.756)4.828none — median 2.699 (q25–q75 2.6–2.775)4.883none — median 2.762 (q25–q75 2.64–2.846)4.943none — median 2.786 (q25–q75 2.715–2.828)5none — median 2.852 (q25–q75 2.784–2.873)5.059none — median 2.938 (q25–q75 2.848–2.984)5.124none — median 3.038 (q25–q75 2.933–3.124)5.185none — median 3.05 (q25–q75 2.922–3.161)5.254none — median 3.052 (q25–q75 2.972–3.137)5.318none — median 3.018 (q25–q75 2.914–3.137)5.39none — median 3.004 (q25–q75 2.878–3.116)5.458none — median 2.895 (q25–q75 2.792–2.971)5.534none — median 2.747 (q25–q75 2.643–2.788)5.606none — median 2.533 (q25–q75 2.472–2.566)5.686none — median 2.156 (q25–q75 2.077–2.248)5.762none — median 2.214 (q25–q75 2.022–2.448)5.846none — median 2.219 (q25–q75 1.938–2.499)5.926none — median 2.018 (q25–q75 1.738–2.286)6.016none — median 1.932 (q25–q75 1.641–2.163)6.101none — median 1.997 (q25–q75 1.739–2.204)6.195none — median 2.104 (q25–q75 1.918–2.3)6.285none — median 2.199 (q25–q75 1.998–2.439)6.386none — median 2.242 (q25–q75 2.052–2.463)6.482none — median 2.192 (q25–q75 1.998–2.415)6.589none — median 2.123 (q25–q75 1.904–2.34)6.691none — median 2.048 (q25–q75 1.854–2.256)6.805none — median 2.09 (q25–q75 1.905–2.304)6.914none — median 2.052 (q25–q75 1.835–2.265)7.036none — median 1.965 (q25–q75 1.716–2.209)7.152none — median 2.019 (q25–q75 1.831–2.171)7.283none — median 1.905 (q25–q75 1.725–2.098)7.408none — median 1.948 (q25–q75 1.76–2.134)7.548none — median 1.808 (q25–q75 1.618–1.993)7.682none — median 1.811 (q25–q75 1.722–1.951)7.821none — median 1.79 (q25–q75 1.685–1.912)7.978none — median 1.862 (q25–q75 1.754–1.989)8.128none — median 1.974 (q25–q75 1.853–2.1)8.297none — median 1.818 (q25–q75 1.729–1.913)8.459none — median 1.826 (q25–q75 1.675–1.967)8.642none — median 1.79 (q25–q75 1.563–1.975)8.819none — median 1.956 (q25–q75 1.726–2.133)9.018none — median 2.48 (q25–q75 1.962–2.895)9.21none — median 2.757 (q25–q75 2.138–3.318)9.428none — median 2.957 (q25–q75 2.508–3.403)9.638none — median 3.318 (q25–q75 2.934–3.793)9.877none — median 3.344 (q25–q75 3.126–3.546)10.108none — median 3.268 (q25–q75 3.149–3.363)10.371none — median 3.277 (q25–q75 3.203–3.419)10.626none — median 3.207 (q25–q75 3.088–3.43)10.917none — median 2.875 (q25–q75 2.687–3.106)11.2none — median 2.709 (q25–q75 2.54–2.939)11.523none — median 2.822 (q25–q75 2.604–3.026)11.839none — median 2.656 (q25–q75 2.538–2.72)12.201none — median 2.246 (q25–q75 2.151–2.334)12.555none — median 2.294 (q25–q75 2.214–2.418)12.964none — median 2.445 (q25–q75 2.29–2.633)13.364none — median 2.382 (q25–q75 2.263–2.527)13.828none — median 2.309 (q25–q75 2.058–2.572)14.285none — median 2.139 (q25–q75 2.088–2.273)14.815none — median 2.574 (q25–q75 2.423–2.778)15.341none — median 2.957 (q25–q75 2.716–3.177)

Sampling

Wavelengths1,736
Axis range2.501–15.34 none
Mean spacing0.0074 none
Gridirregular
Observations4

Signal & quality

Value range0.867 – 6.51
Mean range1.55 – 5.53
Mean level2.715
Area32.78
PTP3.984
Noise RMS0.028599
SNR95
SNR dB4e+01 dB
Dynamic range3.98
Smoothness0.1549
Saturated0.0%
X-outliers0

Integrity & artefacts

NaN ratio0.00%
Inf count0
Zero ratio0.00%
Spike count103
Spike rate1.49%
Jump count39
Jump rate0.56%
Clip fraction0.03%

Shape & reference

Baseline slope-0.7487
Curvature RMS0.1557
D1 RMS0.088414
RMS to mean0.31643
RMS p950.43001
SAM to mean0.086069
SAM p950.14812
Affine offset p951.0984
Affine gain p95 Δ0.34276
Affine residual p950.25873
Xcorr lag p950

Outliers & repeatability

PCA Q p95/median4
Hotelling T2 p95/median1
Mahalanobis H p95/median1
Repeat groups0

Dimensionality (PCA)

Effective rank2.1
PCs → 95% var3
PCs → 99% var3
Top-10 cum. var100.0%
Computed metric scores 29worst 1.00
FamilleMétrique calculéeValeurScoreNiveauInterprétation datasetCauses typiquesCalcul / scoring
Intégrité des donnéesNaN ratiointegrity.nan_ratio0%0.00faibleSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countintegrity.inf_count00.00faibleNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratiointegrity.zero_ratio0%0.00faibleNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceamplitude.mean_reflectance2.71490.55moyenValeur atypique: Trop clair / fond visible ou Trop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveamplitude.area_under_curve32.780.55moyenValeur atypique: Différence d'éclairement ou NormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)amplitude.peak_to_peak3.9840.00faibleVariabilité forteSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceamplitude.variance0.920920.00faibleNormal ou hétérogèneMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSnoise.noise_rms0.0285990.14faibleStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRnoise.snr94.9280.01faibleBon signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRnoise.bandwise_snr_min25.6330.19faibleZone fiableDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countartefacts.spike_count1031.00fortArtefactsCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateartefacts.spike_rate1.49%1.00fortSpectre suspectInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countartefacts.jump_count390.56moyenRaccord détecteurSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateartefacts.jump_rate0.562%0.56moyenProblème spectralCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionartefacts.clip_fraction0.0288%0.03faibleNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopeshape.baseline_slope-0.74870.38faibleStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSshape.curvature_rms0.15571.00fortForme inhabituelleFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSshape.d1_rms0.0884140.44moyenSpectre structuréBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)outliers.pca_q_ratio3.99210.50moyenSpectre atypiqueArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²outliers.hotelling_t2_ratio10.13faibleCentralVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis Houtliers.mahalanobis_h_ratio10.25faiblePopulation normaleDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumreference.rms_to_mean_spectrum_p950.430010.43moyenSpectre différentDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)reference.sam_to_mean_spectrum_p950.148120.42moyenForme différenteFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDrepeatability.rms_intra_id0.00faibleStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDrepeatability.sam_intra_id0.00faibleStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDrepeatability.cv_intra_id0.00faibleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densitystructure.pca_score_density0.0459210.40faibleHomogèneLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)structure.local_outlier_factor_p951.19750.10faiblePopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scorestructure.isolation_forest_score_p950.446910.40faibleNormalDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
X PCA score plot-20-1001020-15-10-50510PC1 -5.13 · PC2 -11.1PC1 12.8 · PC2 3.51PC1 9.755 · PC2 1.12PC1 -17.43 · PC2 6.473PC1 (71.5%)PC2 (21.7%)4 scores
PCA explained variance0%25%50%75%100%PC1: 71.5% (cumulative 71.5%)1PC2: 21.7% (cumulative 93.2%)2PC3: 6.8% (cumulative 100.0%)3cumulative explained variancePC variancecumulativeprincipal component · cumulative (dashed)

Metric interpretation reference

Metric catalog 29
FamilleMétriqueCe qu’elle détecteForte valeur =Faible valeur =Causes typiquesCalcul / score
Intégrité des donnéesNaN ratioDonnées manquantesSpectre corrompuSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countValeurs infiniesCorruptionNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratioColonnes ou cellules nullesSpectre tronquéNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceNiveau moyenTrop clair / fond visibleTrop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveIntensité globaleDifférence d'éclairementNormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)DynamiqueVariabilité forteSpectre platSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceVariabilité spectraleNormal ou hétérogèneSpectre platMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSBruit haute fréquenceBruitéStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRQualité signalBon signalMauvais signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRBruit localiséZone fiableZone problématiqueDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countPics étroitsArtefactsSpectre propreCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateDensité de picsSpectre suspectNormalInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countDiscontinuitésRaccord détecteurContinuSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateFréquence de sautsProblème spectralNormalCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionSaturationClippingNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopePente globaleDériveStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSCourbureForme inhabituelleLisseFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSVariabilité localeSpectre structuréPlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)Non expliqué par PCASpectre atypiqueConformeArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²Extrême dans PCAExtrême mais cohérentCentralVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis HDistance au nuageOutlier globalPopulation normaleDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumDistance moyenneSpectre différentTypiqueDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)Différence de formeForme différenteSimilaireFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDReproductibilitéMauvaise répétabilitéStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDVariation de formeInstableStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDVariabilité interneMauvais contrôleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densityClustersSous-populationsHomogèneLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)Anomalie localeSpectre isoléPopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scoreAnomalie globaleSpectre atypiqueNormalDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
Technology-specific extensions
TechnologieAdaptations / métriquesAnomalies cibléesCommentaire pratique
UV-Vis 300-1000 nmBaseline, pente globale, dérive aux bords 300-350 et 900-1000; métriques par zonesLumière parasite, mauvais blanc, saturation, faible signal aux extrémitésLes bords sont souvent instables; calculer aussi des scores edge/middle.
UV-Vis 300-1000 nmSaturation / clipping proche absorbance max ou réflectance maxSignal écrêtéTrès important si absorption forte.
UV-Vis 300-1000 nmRed-edge, position de maximum, ratios de bandes si végétalDécalage biologique ou artefact optiqueAide à distinguer changement réel et problème d'acquisition.
UV-Vis 300-1000 nmSmoothness / roughness indexBruit haute fréquenceSouvent plus informatif que le SNR seul.
MIR / ATR-FTIRATR contact quality index: intensité globale, aire totale, profondeur des bandes clésMauvais contact cristal-échantillonCrucial: beaucoup d'anomalies viennent du contact ATR.
MIR / ATR-FTIRCO2 / H2O atmospheric bandsMauvaise correction atmosphériquePics parasites fréquents.
MIR / ATR-FTIRBaseline curvature / rubber-band residualDiffusion, contact, dérive baselineTrès utile avant PCA.
MIR / ATR-FTIRPeak position shiftMauvais alignement spectral / calibrationImportant en FTIR car de petits shifts comptent.
MIR / ATR-FTIRBand area ratios sur bandes connuesSpectre chimiquement incohérentÀ adapter par matrice: polysaccharides, protéines, lipides, etc.
HS-MSTotal Ion Current (TIC), Base Peak Intensity (BPI)Injection faible, ionisation instableÉquivalent MS du niveau global spectral.
HS-MSNombre de pics détectésSpectre pauvre ou trop bruitéTrop peu = mauvais signal; trop = bruit/contamination.
HS-MSMass accuracy / m/z driftProblème calibration masseFondamental en HRMS.
HS-MSRetention time drift si LC/GC-MSDérive chromatographiqueÀ suivre sur standards/QC pools.
HS-MSBlank contamination scoreContaminants / carry-overComparer échantillons vs blancs.
HS-MSInternal standard CVVariabilité instrumentaleTrès robuste si standards disponibles.
HS-MSMissingness par featureInstabilité de détectionCrucial pour filtrer les variables.
Avec répétitionsRMS intra-échantillonRépétabilité globaleApplicable à toutes les technologies.
Avec répétitionsSAM / corrélation intra-échantillonRépétabilité de formeTrès utile pour spectres.
Avec répétitionsCV intra-échantillon par bande / featureRépétabilité localeDétecte les zones instables.
Avec répétitionsICC ou variance componentsPart variance échantillon vs techniqueTrès utile si plusieurs répétitions par sample.
Avec répétitionsDistance au centroïde intra-IDRépétition aberrantePermet de flagger la mauvaise répétition plutôt que le sample entier.
Bug-hunting / supervised audits
Famille de bug potentielMéthodes à ajouterCe que ça détecteÉtat dans l’explorateur
Shift spectral globalCorrélation spectre moyen inter-dataset, DTW, cross-correlation, comparaison positions de picsDécalage en longueur d'onde, mauvais alignement, interpolation différentePartiellement calculé: cross-correlation lag et dispersion des positions de pics vs spectre moyen.
Baseline / offset / gainRégression chaque spectre vs spectre moyen: x = a + b ref + residual; suivi de a, b, RMS résiduelOffset additif, effet multiplicatif, dérive de baselineCalculé dans reference.affine_*.
Mélange de lignes / mauvais appariement X-M-YVérification index, hash des lignes, duplication ID, distance spectrale intra-ID, labels incohérentsLignes mélangées, metadata mal alignées, Y attribué au mauvais spectrePartiellement couvert par répétabilité intra-ID; checks index/hash à ajouter au pipeline canonical.
Fuite d'information / répétitions mal splitéesGroupKFold par sample_id vs StratifiedKFold random; audit des partitions par sample_idPerformance artificiellement bonne due aux répétitionsNécessite splits et benchmark modèle; non calculé par la carte descriptive.
Label bugsÉchantillons proches en X mais Y différents, confident learning, erreurs systématiques FP/FNY inversés, erreurs de saisie, classes ambiguësNécessite Y et/ou modèle; recommandé pour l'explorateur supervisé.
Sous-domaines cachésPCA/UMAP/t-SNE + clustering non supervisé + association avec dataset/Y/date/operatorLots, campagnes, sondes, backgrounds non renseignésPartiellement calculé par structure PCA/LOF; UMAP/t-SNE hors carte statique.
Artefacts localisés inconnusCarte wavelength x dataset: différence moyenne, différence variance, KS par longueur d'ondeRégions spectrales anormales non anticipéesÀ calculer au niveau banque quand plusieurs datasets partagent un axe spectral.
Ruptures instrumentalesDiscontinuités dans dérivées, changepoint detectionSplice, raccord détecteur, saut local non prévuCalculé par jump/spike rates; changepoint plus avancé à ajouter.
Mélange / contamination spectraleNMF / unmixing / reconstruction par convex hullComposante externe: fond, plastique, solNon calculé automatiquement; nécessite hypothèses de composants ou grande bibliothèque.
Features instables mais prédictivesImportance modèle vs instabilité QC par variableModèle qui apprend un artefact plutôt qu'un signal biologiqueNécessite modèle supervisé; recommandé pour rapports de benchmark.

Variables

Targets 1

material_name

target · categorical
material_name classesAvena fatuaAvena fatua: 22Bromus diandrusBromus diandrus: 22
n / missing4 / 0
Classes2
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classAvena fatua (2)

Metadata 2

ecostress_resource_id

metadata · categorical
n / missing4 / 0
Classes4
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classvegetation.grass.avena.fatua.tir.vh352.ucsb.nicolet.spectrum (1)

location

metadata · categorical
location classes34.5143, -119.798367, WGS8434.5143, -119.798367, WGS84: 3334.51457, -119.79877, WGS8434.51457, -119.79877, WGS84: 11
n / missing4 / 0
Classes2
Balance (entropy)0.81
Imbalance ratio3
Top class34.5143, -119.798367, WGS84 (3)
Constant metadata 17
  • categoryvegetation
  • material_typevegetation
  • date3/18/2015
  • speciesgrass
  • sample_descriptionSamples were collected as part of the HyspIRI Airborne Campaign proposal titled: HyspIRI discrimination of plant species and functional types along a strong environmental temperature gradient. The same materials were processed in the Nicolet and then measured using the ASD.
  • instrumentucsb.nicolet
  • acquisition_modeHemispherical reflectance
  • signal_typeReflectance (percentage)
  • axis_unitWavelength (micrometer)
  • axis_min2.501
  • axis_max15.34
  • n_points_original1,736
  • publication_doi10.1016/j.rse.2019.05.015
  • citationMeerdink et al. 2019, Baldridge et al. 2009
  • licenseCopyright California Institute of Technology / JPL, all rights reserved
  • rights_statusmanual_review_needed
  • usage_scopeprivate_use_only

8 variable(s) omitted (no recorded values).

Alignment

Alignment levelobservation
Sample id availableyes
Samples4
Observations (total)4
Reps per samplemin 1 · mean 1 · max 1

Provenance & citation

ContributorECOSTRESS Spectral Library
Origin · url [open]https://speclib.jpl.nasa.gov/download
Origin · url [open]https://speclib.jpl.nasa.gov/
Origin · script [manual]source_to_standard.py — standardization script (maintainer-only)
Publication10.1016/j.rse.2019.05.015 — The ECOSTRESS spectral library version 1.0
Publication10.1016/j.rse.2008.11.007 — The ASTER Spectral Library Version 2.0

Governance & integrity

Tierprivate
LicenseLicenseRef-not-cleared
Permitted useResearch and benchmarking; private use only.
Access policyManual download / private-use-only per source.
RedistributionOfficial ECOSTRESS page requests citation and states copyright/all rights reserved; converted matrices are private/internal until redistribution rights are clarified.
Content version1.0.0
Schema / protocol2.0
Content hash5e96e6d0145fd543…
Processing hash0af1d33a148fca22…
Metadata hash6b07a49d47bd5d30…

Load this dataset

# pip install nirs4all-datasets
from nirs4all_datasets import get

# private dataset — export requires a Dataverse token
ds = get("ecostress_vegetation_tir_1736points", token="…")
X, y = ds.x(), ds.y()
print(X.shape, y.shape)

Metadata downloads are available for public datasets only. The dataset bytes are never served here — fetch them from the origin / DOI above.