ossl neospectra nir soil all y — nirs4all-datasets

8,151

samples

601

wavelengths

sources

targets

metadata

NIR

family

Dataset property explorer

Mean profile risk0.54

Highest axisArtefacts locaux · 1.00

Diagnostics8

Sources profiled1

Profile axes

Intégrité	0.00
Artefacts locaux	1.00
Bruit	0.00
Outliers PCA	1.00
Distance à la référence	1.00
Répétabilité	0.00
Baseline / forme	0.30
Structure multi-régimes	1.00

Diagnostic	Score	Force	Signaux	Interprétation probable
Splice / raccord détecteursX	0.79	forte	Spike rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00, SNR non dégradé 1.00	Rupture aux jonctions de détecteurs, calibration locale ou sonde différente.
Spectre hors domaine valideX	0.74	forte	Mahalanobis / T2 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Structure PCA 1.00	Variété, espèce, lot ou condition différente mais physiquement plausible.
Dataset multi-régimesX	0.70	moyenne	Structure PCA 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 1.00	Mélange de campagnes, opérateurs, lots, setups ou sous-populations spectrales.
Signature VERA25-likeX	0.69	moyenne	Mahalanobis / T2 1.00, Spike rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00	Combinaison possible changement de sonde + splice, amplifiée par géométrie, fond ou calibration.
Erreur interpolation / rééchantillonnageX	0.65	moyenne	Spike rate 1.00, SNR normal/élevé 1.00, Noise RMS faible 1.00	Artefacts numériques ou traitement spectral incorrect.
Erreur calibration / référence blancheX	0.62	moyenne	Mahalanobis / T2 1.00, RMS/SAM référence 1.00, artefacts locaux 1.00	Décalage systématique entre campagnes, instruments ou référence blanche.
Différence de sonde / géométrieX	0.60	moyenne	Mahalanobis / T2 1.00, RMS/SAM référence 1.00, PCA Q 0.86	Modification de l'illumination, collecte, angle ou distance sonde-échantillon.
Fond différentX	0.58	moyenne	Mahalanobis / T2 1.00, RMS/SAM référence 1.00, PCA Q 0.86	Effet systématique du support, blanc/noir, transflectance ou environnement de mesure.

Spectral sources

recovered_spectra

X · NIR · unknown

Sampling

Wavelengths	601
Axis range	1,350–2,550 none
Mean spacing	2 none
Grid	uniform
Observations	8,151

Signal & quality

Value range	0.0721 – 1.14
Mean range	0.41 – 0.587
Mean level	0.5144
Area	617.4
PTP	0.1766
Noise RMS	2.4208e-05
SNR	2.1e+04
SNR dB	9e+01 dB
Dynamic range	0.177
Smoothness	0.0001837
Saturated	0.0%
X-outliers	4,325

Integrity & artefacts

NaN ratio	0.00%
Inf count	0
Zero ratio	0.00%
Spike count	157,716
Spike rate	3.23%
Jump count	18,240
Jump rate	0.37%
Clip fraction	0.00%

Shape & reference

Baseline slope	-0.027775
Curvature RMS	0.0001613
D1 RMS	0.0012429
RMS to mean	0.09446
RMS p95	0.26338
SAM to mean	0.039886
SAM p95	0.10924
Affine offset p95	0.35508
Affine gain p95 Δ	0.71961
Affine residual p95	0.04626
Xcorr lag p95	2

Outliers & repeatability

PCA Q p95/median	6.9
Hotelling T2 p95/median	8.1
Mahalanobis H p95/median	2.8
Repeat groups	0

Dimensionality (PCA)

Effective rank	1.3
PCs → 95% var	1
PCs → 99% var	2
Top-10 cum. var	100.0%

Computed metric scores 29worst 1.00

Famille	Métrique calculée	Valeur	Score	Niveau	Interprétation dataset	Causes typiques	Calcul / scoring
Intégrité des données	`NaN ratio`integrity.nan_ratio	0%	0.00	faible	Spectre complet	Erreur acquisition/export	count(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des données	`Inf count`integrity.inf_count	0	0.00	faible	Normal	Calculs invalides	count(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des données	`Zero ratio`integrity.zero_ratio	0%	0.00	faible	Normal	Export, saturation	count(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globale	`Mean reflectance`amplitude.mean_reflectance	0.51435	0.30	faible	Trop sombre	Fond, géométrie	mean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globale	`Area under curve`amplitude.area_under_curve	617.39	0.30	faible	Normal	Distance sonde	trapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globale	`Peak-to-peak (PTP)`amplitude.peak_to_peak	0.17663	0.00	faible	Variabilité forte	Saturation	max(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globale	`Variance`amplitude.variance	0.020728	0.00	faible	Normal ou hétérogène	Mauvais contact	var(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
Bruit	`Noise RMS`noise.noise_rms	2.4208e-05	0.00	faible	Stable	Lampe, détecteur	median MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
Bruit	`SNR`noise.snr	21248	0.00	faible	Bon signal	Acquisition	mean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
Bruit	`Bandwise SNR`noise.bandwise_snr_min	2069.7	0.00	faible	Zone fiable	Détecteur	min(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locaux	`Spike count`artefacts.spike_count	157,716	1.00	fort	Artefacts	Cosmic rays, splice	count robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locaux	`Spike rate`artefacts.spike_rate	3.23%	1.00	fort	Spectre suspect	Interpolation	spike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locaux	`Jump count`artefacts.jump_count	18,240	0.37	faible	Continu	Splice	count robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locaux	`Jump rate`artefacts.jump_rate	0.373%	0.37	faible	Normal	Calibration	jump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locaux	`Clip fraction`artefacts.clip_fraction	4.08e-05%	0.00	faible	Normal	Détecteur saturé	fraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectrale	`Baseline slope`shape.baseline_slope	-0.027775	0.11	faible	Stable	Éclairement	linear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectrale	`Curvature RMS`shape.curvature_rms	0.0001613	0.03	faible	Lisse	Fond, splice	median RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectrale	`D1 RMS`shape.d1_rms	0.0012429	0.05	faible	Plat	Biologie ou artefact	median RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariés	`PCA Q (SPE)`outliers.pca_q_ratio	6.9109	0.86	fort	Spectre atypique	Artefact, mélange	p95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariés	`Hotelling T²`outliers.hotelling_t2_ratio	8.0702	1.00	fort	Extrême mais cohérent	Variabilité naturelle	p95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariés	`Mahalanobis H`outliers.mahalanobis_h_ratio	2.8408	0.71	moyen	Outlier global	Domaine différent	p95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référence	`RMS to mean spectrum`reference.rms_to_mean_spectrum_p95	0.26338	1.00	fort	Spectre différent	Domain shift	p95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référence	`Spectral Angle Mapper (SAM)`reference.sam_to_mean_spectrum_p95	0.10924	0.31	faible	Similaire	Fond, géométrie	p95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
Répétabilité	`RMS intra-ID`repeatability.rms_intra_id	—	0.00	faible	Stable	Positionnement	median RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
Répétabilité	`SAM intra-ID`repeatability.sam_intra_id	—	0.00	faible	Stable	Acquisition	median SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
Répétabilité	`CV intra-ID`repeatability.cv_intra_id	—	0.00	faible	Stable	Opérateur	median within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du dataset	`PCA score density`structure.pca_score_density	33.051	1.00	fort	Sous-populations	Lots différents	1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du dataset	`Local Outlier Factor (LOF)`structure.local_outlier_factor_p95	4.4489	1.00	fort	Spectre isolé	Cas rares	p95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du dataset	`Isolation Forest score`structure.isolation_forest_score_p95	0.58884	1.00	fort	Spectre atypique	Diverses causes	p95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent

X-Y spectral correlation 20

Target	max \|r\|	axis @ max	mean \|r\|	\|r\| ≥ .5
oc_usda_c729_w_pct	0.265	2,120	0.233	0.0%
c_tot_usda_a622_w_pct	0.235	2,120	0.21	0.0%
n_tot_usda_a623_w_pct	0.3	1,350	0.27	0.0%
s_tot_usda_a624_w_pct	0.163	1,942	0.0687	0.0%
ph_h2o_usda_a268_index	0.262	1,910	0.118	0.0%
bd_usda_a4_g_cm3	0.348	2,124	0.32	0.0%
clay_tot_usda_a334_w_pct	0.428	2,550	0.247	0.0%
silt_tot_usda_c62_w_pct	0.23	2,536	0.188	0.0%
sand_tot_usda_c60_w_pct	0.0505	2,550	0.0274	0.0%
caco3_usda_a54_w_pct	0.281	2,192	0.24	0.0%
cec_usda_a723_cmolc_kg	0.45	1,914	0.386	0.0%
ca_ext_usda_a722_cmolc_kg	0.259	1,940	0.112	0.0%
mg_ext_usda_a724_cmolc_kg	0.298	1,910	0.221	0.0%
k_ext_usda_a725_cmolc_kg	0.269	1,912	0.208	0.0%
na_ext_usda_a726_cmolc_kg	0.0987	1,982	0.0887	0.0%
wr_33kPa_usda_a415_w_pct	0.346	2,362	0.302	0.0%
wr_1500kPa_usda_a417_w_pct	0.434	2,550	0.343	0.0%
al_dith_usda_a65_w_pct	0.198	2,174	0.14	0.0%
p_ext_usda_a652_mg_kg	0.0395	2,550	0.0109	0.0%
p_ext_usda_a1070_mg_kg	0.37	1,350	0.281	0.0%

Metric interpretation reference

Metric catalog 29

Famille	Métrique	Ce qu’elle détecte	Forte valeur =	Faible valeur =	Causes typiques	Calcul / score
Intégrité des données	`NaN ratio`	Données manquantes	Spectre corrompu	Spectre complet	Erreur acquisition/export	count(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des données	`Inf count`	Valeurs infinies	Corruption	Normal	Calculs invalides	count(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des données	`Zero ratio`	Colonnes ou cellules nulles	Spectre tronqué	Normal	Export, saturation	count(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globale	`Mean reflectance`	Niveau moyen	Trop clair / fond visible	Trop sombre	Fond, géométrie	mean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globale	`Area under curve`	Intensité globale	Différence d'éclairement	Normal	Distance sonde	trapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globale	`Peak-to-peak (PTP)`	Dynamique	Variabilité forte	Spectre plat	Saturation	max(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globale	`Variance`	Variabilité spectrale	Normal ou hétérogène	Spectre plat	Mauvais contact	var(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
Bruit	`Noise RMS`	Bruit haute fréquence	Bruité	Stable	Lampe, détecteur	median MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
Bruit	`SNR`	Qualité signal	Bon signal	Mauvais signal	Acquisition	mean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
Bruit	`Bandwise SNR`	Bruit localisé	Zone fiable	Zone problématique	Détecteur	min(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locaux	`Spike count`	Pics étroits	Artefacts	Spectre propre	Cosmic rays, splice	count robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locaux	`Spike rate`	Densité de pics	Spectre suspect	Normal	Interpolation	spike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locaux	`Jump count`	Discontinuités	Raccord détecteur	Continu	Splice	count robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locaux	`Jump rate`	Fréquence de sauts	Problème spectral	Normal	Calibration	jump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locaux	`Clip fraction`	Saturation	Clipping	Normal	Détecteur saturé	fraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectrale	`Baseline slope`	Pente globale	Dérive	Stable	Éclairement	linear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectrale	`Curvature RMS`	Courbure	Forme inhabituelle	Lisse	Fond, splice	median RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectrale	`D1 RMS`	Variabilité locale	Spectre structuré	Plat	Biologie ou artefact	median RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariés	`PCA Q (SPE)`	Non expliqué par PCA	Spectre atypique	Conforme	Artefact, mélange	p95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariés	`Hotelling T²`	Extrême dans PCA	Extrême mais cohérent	Central	Variabilité naturelle	p95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariés	`Mahalanobis H`	Distance au nuage	Outlier global	Population normale	Domaine différent	p95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référence	`RMS to mean spectrum`	Distance moyenne	Spectre différent	Typique	Domain shift	p95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référence	`Spectral Angle Mapper (SAM)`	Différence de forme	Forme différente	Similaire	Fond, géométrie	p95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
Répétabilité	`RMS intra-ID`	Reproductibilité	Mauvaise répétabilité	Stable	Positionnement	median RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
Répétabilité	`SAM intra-ID`	Variation de forme	Instable	Stable	Acquisition	median SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
Répétabilité	`CV intra-ID`	Variabilité interne	Mauvais contrôle	Stable	Opérateur	median within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du dataset	`PCA score density`	Clusters	Sous-populations	Homogène	Lots différents	1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du dataset	`Local Outlier Factor (LOF)`	Anomalie locale	Spectre isolé	Population normale	Cas rares	p95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du dataset	`Isolation Forest score`	Anomalie globale	Spectre atypique	Normal	Diverses causes	p95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent

Technology-specific extensions

Technologie	Adaptations / métriques	Anomalies ciblées	Commentaire pratique
UV-Vis 300-1000 nm	Baseline, pente globale, dérive aux bords 300-350 et 900-1000; métriques par zones	Lumière parasite, mauvais blanc, saturation, faible signal aux extrémités	Les bords sont souvent instables; calculer aussi des scores edge/middle.
UV-Vis 300-1000 nm	Saturation / clipping proche absorbance max ou réflectance max	Signal écrêté	Très important si absorption forte.
UV-Vis 300-1000 nm	Red-edge, position de maximum, ratios de bandes si végétal	Décalage biologique ou artefact optique	Aide à distinguer changement réel et problème d'acquisition.
UV-Vis 300-1000 nm	Smoothness / roughness index	Bruit haute fréquence	Souvent plus informatif que le SNR seul.
MIR / ATR-FTIR	ATR contact quality index: intensité globale, aire totale, profondeur des bandes clés	Mauvais contact cristal-échantillon	Crucial: beaucoup d'anomalies viennent du contact ATR.
MIR / ATR-FTIR	CO2 / H2O atmospheric bands	Mauvaise correction atmosphérique	Pics parasites fréquents.
MIR / ATR-FTIR	Baseline curvature / rubber-band residual	Diffusion, contact, dérive baseline	Très utile avant PCA.
MIR / ATR-FTIR	Peak position shift	Mauvais alignement spectral / calibration	Important en FTIR car de petits shifts comptent.
MIR / ATR-FTIR	Band area ratios sur bandes connues	Spectre chimiquement incohérent	À adapter par matrice: polysaccharides, protéines, lipides, etc.
HS-MS	Total Ion Current (TIC), Base Peak Intensity (BPI)	Injection faible, ionisation instable	Équivalent MS du niveau global spectral.
HS-MS	Nombre de pics détectés	Spectre pauvre ou trop bruité	Trop peu = mauvais signal; trop = bruit/contamination.
HS-MS	Mass accuracy / m/z drift	Problème calibration masse	Fondamental en HRMS.
HS-MS	Retention time drift si LC/GC-MS	Dérive chromatographique	À suivre sur standards/QC pools.
HS-MS	Blank contamination score	Contaminants / carry-over	Comparer échantillons vs blancs.
HS-MS	Internal standard CV	Variabilité instrumentale	Très robuste si standards disponibles.
HS-MS	Missingness par feature	Instabilité de détection	Crucial pour filtrer les variables.
Avec répétitions	RMS intra-échantillon	Répétabilité globale	Applicable à toutes les technologies.
Avec répétitions	SAM / corrélation intra-échantillon	Répétabilité de forme	Très utile pour spectres.
Avec répétitions	CV intra-échantillon par bande / feature	Répétabilité locale	Détecte les zones instables.
Avec répétitions	ICC ou variance components	Part variance échantillon vs technique	Très utile si plusieurs répétitions par sample.
Avec répétitions	Distance au centroïde intra-ID	Répétition aberrante	Permet de flagger la mauvaise répétition plutôt que le sample entier.

Bug-hunting / supervised audits

Famille de bug potentiel	Méthodes à ajouter	Ce que ça détecte	État dans l’explorateur
Shift spectral global	Corrélation spectre moyen inter-dataset, DTW, cross-correlation, comparaison positions de pics	Décalage en longueur d'onde, mauvais alignement, interpolation différente	Partiellement calculé: cross-correlation lag et dispersion des positions de pics vs spectre moyen.
Baseline / offset / gain	Régression chaque spectre vs spectre moyen: x = a + b ref + residual; suivi de a, b, RMS résiduel	Offset additif, effet multiplicatif, dérive de baseline	Calculé dans reference.affine_*.
Mélange de lignes / mauvais appariement X-M-Y	Vérification index, hash des lignes, duplication ID, distance spectrale intra-ID, labels incohérents	Lignes mélangées, metadata mal alignées, Y attribué au mauvais spectre	Partiellement couvert par répétabilité intra-ID; checks index/hash à ajouter au pipeline canonical.
Fuite d'information / répétitions mal splitées	GroupKFold par sample_id vs StratifiedKFold random; audit des partitions par sample_id	Performance artificiellement bonne due aux répétitions	Nécessite splits et benchmark modèle; non calculé par la carte descriptive.
Label bugs	Échantillons proches en X mais Y différents, confident learning, erreurs systématiques FP/FN	Y inversés, erreurs de saisie, classes ambiguës	Nécessite Y et/ou modèle; recommandé pour l'explorateur supervisé.
Sous-domaines cachés	PCA/UMAP/t-SNE + clustering non supervisé + association avec dataset/Y/date/operator	Lots, campagnes, sondes, backgrounds non renseignés	Partiellement calculé par structure PCA/LOF; UMAP/t-SNE hors carte statique.
Artefacts localisés inconnus	Carte wavelength x dataset: différence moyenne, différence variance, KS par longueur d'onde	Régions spectrales anormales non anticipées	À calculer au niveau banque quand plusieurs datasets partagent un axe spectral.
Ruptures instrumentales	Discontinuités dans dérivées, changepoint detection	Splice, raccord détecteur, saut local non prévu	Calculé par jump/spike rates; changepoint plus avancé à ajouter.
Mélange / contamination spectrale	NMF / unmixing / reconstruction par convex hull	Composante externe: fond, plastique, sol	Non calculé automatiquement; nécessite hypothèses de composants ou grande bibliothèque.
Features instables mais prédictives	Importance modèle vs instabilité QC par variable	Modèle qui apprend un artefact plutôt qu'un signal biologique	Nécessite modèle supervisé; recommandé pour rapports de benchmark.

Variables

Targets 23

oc_usda_c729_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	1.917 ± 3.08
Median	1.17
Range	-0.028 – 53.88
CV	1.61
Skew / kurtosis	9.2 / 1.3e+02
Normal?	no

c_tot_usda_a622_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 180
Mean ± SD	2.213 ± 3.14
Median	1.467
Range	0.0161 – 53.88
CV	1.42
Skew / kurtosis	8.7 / 1.2e+02
Normal?	no

n_tot_usda_a623_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	0.159 ± 0.199
Median	0.113
Range	0 – 3.02
CV	1.25
Skew / kurtosis	7.4 / 88
Normal?	no

s_tot_usda_a624_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 180
Mean ± SD	0.132 ± 0.996
Median	0.01322
Range	0 – 18.38
CV	7.55
Skew / kurtosis	14 / 2.1e+02
Normal?	no

ph_h2o_usda_a268_index

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	6.313 ± 1.27
Median	6.17
Range	3.69 – 9.52
CV	0.202
Skew / kurtosis	0.17 / -1.1
Normal?	no

bd_usda_a4_g_cm3

target · numeric

n / missing	8,151 / 4,241
Mean ± SD	1.326 ± 0.24
Median	1.348
Range	0.3004 – 2.033
CV	0.181
Skew / kurtosis	-0.62 / 1
Normal?	no

clay_tot_usda_a334_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	20.43 ± 14.5
Median	18.29
Range	0 – 86.69
CV	0.711
Skew / kurtosis	0.94 / 1
Normal?	no

silt_tot_usda_c62_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	38.52 ± 20.8
Median	38.1
Range	0 – 87.9
CV	0.54
Skew / kurtosis	0.17 / -0.78
Normal?	no

sand_tot_usda_c60_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	41.05 ± 28.5
Median	38
Range	0.3 – 100
CV	0.694
Skew / kurtosis	0.3 / -1.1
Normal?	no

caco3_usda_a54_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 5,343
Mean ± SD	6.386 ± 9.66
Median	1.756
Range	-0.5671 – 89.03
CV	1.51
Skew / kurtosis	2.5 / 9.6
Normal?	no

efferv_usda_a479_class

target · categorical

n / missing	8,151 / 197
Classes	5
Balance (entropy)	0.61
Imbalance ratio	1e+01
Top class	none (5,688)

cec_usda_a723_cmolc_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	16.11 ± 13.1
Median	14.05
Range	0.134 – 190.1
CV	0.814
Skew / kurtosis	4.6 / 45
Normal?	no

ca_ext_usda_a722_cmolc_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	20.07 ± 33.7
Median	9.862
Range	0 – 363.6
CV	1.68
Skew / kurtosis	5 / 34
Normal?	no

mg_ext_usda_a724_cmolc_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	3.476 ± 4.95
Median	2.023
Range	0 – 82.14
CV	1.42
Skew / kurtosis	5.4 / 56
Normal?	no

k_ext_usda_a725_cmolc_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	0.5317 ± 0.683
Median	0.3277
Range	0 – 11.25
CV	1.28
Skew / kurtosis	4.4 / 35
Normal?	no

na_ext_usda_a726_cmolc_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 20
Mean ± SD	1.359 ± 10.8
Median	0
Range	0 – 203
CV	7.93
Skew / kurtosis	12 / 1.7e+02
Normal?	no

wr_33kPa_usda_a415_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 7,431
Mean ± SD	23.95 ± 15
Median	23.9
Range	1.003 – 127.9
CV	0.624
Skew / kurtosis	2.8 / 18
Normal?	no

wr_1500kPa_usda_a417_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 170
Mean ± SD	11.64 ± 7.67
Median	10.74
Range	0.07522 – 96.14
CV	0.659
Skew / kurtosis	2.7 / 20
Normal?	no

al_dith_usda_a65_w_pct

target · numeric

n / missing	8,151 / 1,282
Mean ± SD	0.1832 ± 0.262
Median	0.1102
Range	0 – 2.285
CV	1.43
Skew / kurtosis	3.5 / 15
Normal?	no

p_ext_usda_a652_mg_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 5,355
Mean ± SD	28.83 ± 64.8
Median	10.07
Range	0 – 1359
CV	2.25
Skew / kurtosis	9.1 / 1.4e+02
Normal?	no

p_ext_usda_a1070_mg_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 7,889
Mean ± SD	25.99 ± 31.4
Median	15.91
Range	0.3618 – 256.4
CV	1.21
Skew / kurtosis	3.5 / 21
Normal?	no

k_ext_usda_a1065_mg_kg

target · numeric

n / missing	8,151 / 7,889
Mean ± SD	167 ± 117
Median	136.2
Range	0 – 730.2
CV	0.701
Skew / kurtosis	1.7 / 4.4
Normal?	no

ec_usda_a364_ds_m

target · numeric

n / missing	8,151 / 4,378
Mean ± SD	1.423 ± 6.26
Median	0.23
Range	0.012 – 81.93
CV	4.4
Skew / kurtosis	8.3 / 78
Normal?	no

Metadata 14

ID_sample

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	2,106
Balance (entropy)	0.98
Imbalance ratio	19
Top class	67922 (19)

SpectralRep

metadata · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	2.941 ± 1.96
Median	2
Range	1 – 19
CV	0.667
Skew / kurtosis	2.3 / 12
Normal?	no

scan_local_id

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	8,067
Balance (entropy)	1
Imbalance ratio	4
Top class	NEO2_067922 (4)

scan_lab

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	2
Balance (entropy)	0.96
Imbalance ratio	2
Top class	KSSL (5,009)

scan_model_name

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	9
Balance (entropy)	0.98
Imbalance ratio	2
Top class	NEO3 (1,132)

scan_model_code

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	9
Balance (entropy)	0.98
Imbalance ratio	2
Top class	21020076 (1,132)

country_iso3166

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	4
Balance (entropy)	0.089
Imbalance ratio	4e+02
Top class	USA (7,971)

upper_depth_cm

metadata · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	22.95 ± 36.3
Median	8
Range	0 – 210
CV	1.58
Skew / kurtosis	2.2 / 4.5
Normal?	no

lower_depth_cm

metadata · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	40.43 ± 45.8
Median	22
Range	1 – 254
CV	1.13
Skew / kurtosis	2 / 3.8
Normal?	no

texture_class

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 1,917
Classes	136
Balance (entropy)	0.68
Imbalance ratio	622
Top class	Silt loam (1,244)

pedon_taxa

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 618
Classes	850
Balance (entropy)	0.93
Imbalance ratio	127
Top class	Mixed, thermic Lamellic Ustipsamment (254)

horizon_designation

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 297
Classes	257
Balance (entropy)	0.69
Imbalance ratio	653
Top class	A (1,306)

raw_label

metadata · categorical

n / missing	8,151 / 0
Classes	2,083
Balance (entropy)	0.98
Imbalance ratio	50
Top class	0.0 (50)

reference_value

metadata · numeric

n / missing	8,151 / 0
Mean ± SD	20.43 ± 14.5
Median	18.29
Range	0 – 86.69
CV	0.711
Skew / kurtosis	0.94 / 1
Normal?	no

Constant metadata 14

datasetNeospectra database v1.2
collection_nameneospectra_nir
dataset_codeNEOSPECTRA.NIR
dataset_titleNeospectra NIR soil spectral library
dataset_ownerUSDA-NRCS-NSSC-KSSL, WCRC, UNL, iSDA
dataset_slugNEOSPECTRA.NIR
task_typeregression
trait_headerclay_tot_usda_a334_w_pct
trait_header_originalclay.tot_usda.a334_w.pct
spectral_kindnir
scan_preparation<2 mm
feature_count_per_dimension601
dimensions1D
wavelength_noteneospectra_nir_1350_2550_nm_step_2

3 variable(s) omitted (no recorded values).

Alignment

Alignment level	observation
Sample id available	no
Samples	8,151
Observations (total)	8,151
Reps per sample	min 1 · mean 1 · max 1

Splits

original	all: 8,151 documented · not applied

Provenance & citation

Contributor	OSSL_NIRS
Origin · url [open]	https://storage.googleapis.com/soilspec4gg-public/neospectra_nir_v1.2.csv.gz
Origin · url [open]	https://storage.googleapis.com/soilspec4gg-public/neospectra_soilsite_v1.2.csv.gz
Origin · url [open]	https://storage.googleapis.com/soilspec4gg-public/neospectra_soillab_v1.2.csv.gz
Origin · script [manual]	source_to_standard.py — standardization script (maintainer-only)

Governance & integrity

Tier	private
License	LicenseRef-not-cleared
Permitted use	Research and benchmarking; private use only.
Access policy	Manual download / private-use-only per source.
Redistribution	Recovered from local initial-source exports; rights not cleared for redistribution.
Content version	1.0.0
Schema / protocol	2.0
Content hash	`8238c194c27b95b8…`
Processing hash	`8c86b608e46fa2dd…`
Metadata hash	`902df92da3f382b1…`

Load this dataset

# pip install nirs4all-datasets
from nirs4all_datasets import get

# private dataset — export requires a Dataverse token
ds = get("ossl_neospectra_nir_soil_all_y", token="…")
X, y = ds.x(), ds.y()
print(X.shape, y.shape)

Metadata downloads are available for public datasets only. The dataset bytes are never served here — fetch them from the origin / DOI above.