← Back to the catalog
Publicraw reproducible

ROD Raman native-axis 972-point mineral subset 5b53a6fe

rod · Raman

ROD Raman native-axis 972-point mineral subset 5b53a6fe. v2.0 standardized NIRS package: 1 spectral source(s), 4 declared target(s). Auto-generated from dataset_card.json (verify before publication).

nirv2rod
30
samples
972
wavelengths
1
sources
4
targets
21
metadata
Raman
family

Dataset property explorer

Mean profile risk0.57
Highest axisArtefacts locaux · 1.00
Diagnostics8
Sources profiled1
ROD Raman native-axis 972-point mineral subset 5b53a6fe property profile0.250.50.751integritynoiseartefactsbaselinePCA outliersreferencerepeatabilitystructureROD Raman native-axis 972-point mineral subset 5b53a6fe profileintegrity: 0.00noise: 0.02artefacts: 1.00baseline: 1.00PCA outliers: 0.51reference: 1.00repeatability: 0.00structure: 1.00ROD Raman nativ…0 center · 1 outer ring · outward = stronger anomaly / heterogeneity signal

Profile axes

Intégrité0.00
Artefacts locaux1.00
Bruit0.02
Outliers PCA0.51
Distance à la référence1.00
Répétabilité0.00
Baseline / forme1.00
Structure multi-régimes1.00
Diagnostic hypotheses00.250.50.751hypothesis scoreSplice / raccord détecteursSplice / raccord détecteurs: 0.820.82Erreur calibration / référenc…Erreur calibration / référence blanche: 0.720.72Fond différentFond différent: 0.650.65Erreur interpolation / réécha…Erreur interpolation / rééchantillonnage: 0.610.61Signature VERA25-likeSignature VERA25-like: 0.600.60Différence de sonde / géométr…Différence de sonde / géométrie: 0.570.57Dataset multi-régimesDataset multi-régimes: 0.550.55Spectre hors domaine valideSpectre hors domaine valide: 0.540.54
DiagnosticScoreForceSignauxInterprétation probable
Splice / raccord détecteursX0.82forteSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00Rupture aux jonctions de détecteurs, calibration locale ou sonde différente.
Erreur calibration / référence blancheX0.72forteBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, artefacts locaux 1.00Décalage systématique entre campagnes, instruments ou référence blanche.
Fond différentX0.65moyenneBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.51Effet systématique du support, blanc/noir, transflectance ou environnement de mesure.
Erreur interpolation / rééchantillonnageX0.61moyenneSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, Noise RMS faible 0.98Artefacts numériques ou traitement spectral incorrect.
Signature VERA25-likeX0.60moyenneSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00Combinaison possible changement de sonde + splice, amplifiée par géométrie, fond ou calibration.
Différence de sonde / géométrieX0.57moyenneBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.51Modification de l'illumination, collecte, angle ou distance sonde-échantillon.
Dataset multi-régimesX0.55moyenneStructure PCA 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.51Mélange de campagnes, opérateurs, lots, setups ou sous-populations spectrales.
Spectre hors domaine valideX0.54moyenneRMS/SAM référence 1.00, Structure PCA 1.00, Mahalanobis / T2 0.51Variété, espèce, lot ou condition différente mais physiquement plausible.

Spectral sources

ROD native Raman axis group

X · Raman · ROD source metadata, not consistently specified
ROD native Raman axis group spectra010,00020,00030,00040,00005001,0001,5002,000q05-q95 envelopeq25-q75 envelopemedian spectrummedianq25–q75q05–q95wavelength / cm-1102.28cm-1 — median 2456 (q25–q75 595.2–6403)117.97cm-1 — median 3665 (q25–q75 795.8–8609)133.62cm-1 — median 3724 (q25–q75 1277–1.17e+04)149.25cm-1 — median 3481 (q25–q75 1007–1.212e+04)164.84cm-1 — median 2548 (q25–q75 869.2–8613)180.39cm-1 — median 1266 (q25–q75 634.1–5635)195.92cm-1 — median 1301 (q25–q75 559.3–9227)211.41cm-1 — median 1893 (q25–q75 515.9–5430)226.87cm-1 — median 1590 (q25–q75 450.6–4896)242.29cm-1 — median 914.6 (q25–q75 394.2–4720)257.69cm-1 — median 832.5 (q25–q75 351.2–3535)273.05cm-1 — median 936.5 (q25–q75 360.7–3372)288.38cm-1 — median 1136 (q25–q75 309.4–3967)303.68cm-1 — median 983.9 (q25–q75 268–3853)318.95cm-1 — median 919.1 (q25–q75 258.4–3154)334.18cm-1 — median 788.4 (q25–q75 251.8–2974)349.38cm-1 — median 863.8 (q25–q75 248.1–3422)364.55cm-1 — median 866 (q25–q75 249–3891)379.69cm-1 — median 933 (q25–q75 274.3–3543)394.8cm-1 — median 1033 (q25–q75 276.1–2,209)409.88cm-1 — median 926.4 (q25–q75 314.5–3188)424.92cm-1 — median 916.5 (q25–q75 278.6–2638)439.94cm-1 — median 919.1 (q25–q75 253.5–2867)454.92cm-1 — median 1103 (q25–q75 219.5–2044)469.87cm-1 — median 1432 (q25–q75 206.9–4104)484.79cm-1 — median 1099 (q25–q75 208.7–4,061)499.68cm-1 — median 917.8 (q25–q75 249.2–4258)514.54cm-1 — median 864.8 (q25–q75 271.8–2308)529.37cm-1 — median 881.1 (q25–q75 259.9–2092)544.17cm-1 — median 910.7 (q25–q75 224.4–2368)558.93cm-1 — median 822.4 (q25–q75 217.7–1615)573.67cm-1 — median 745.4 (q25–q75 223.8–2072)588.38cm-1 — median 694.4 (q25–q75 238.9–1554)603.05cm-1 — median 644.4 (q25–q75 227.4–1406)617.7cm-1 — median 648.9 (q25–q75 268.3–1551)630.23cm-1 — median 873.1 (q25–q75 334.1–3787)644.82cm-1 — median 854.6 (q25–q75 338.2–2191)659.38cm-1 — median 754 (q25–q75 448.7–1394)673.91cm-1 — median 717.1 (q25–q75 264.6–3560)688.41cm-1 — median 697 (q25–q75 255.7–1992)702.88cm-1 — median 674 (q25–q75 264.4–3467)717.33cm-1 — median 650.8 (q25–q75 315.8–3242)731.74cm-1 — median 567.9 (q25–q75 286.5–2316)746.12cm-1 — median 636.7 (q25–q75 290.4–1671)760.47cm-1 — median 540.5 (q25–q75 268.1–1278)774.8cm-1 — median 515.9 (q25–q75 258.9–1277)789.09cm-1 — median 534.8 (q25–q75 247–1224)803.36cm-1 — median 536 (q25–q75 233–1426)817.59cm-1 — median 539.5 (q25–q75 234.4–1,320)831.8cm-1 — median 549.7 (q25–q75 275.7–1315)845.98cm-1 — median 542.4 (q25–q75 228.8–1321)860.13cm-1 — median 528.5 (q25–q75 222.2–1345)874.25cm-1 — median 520.1 (q25–q75 216–1486)888.35cm-1 — median 514.9 (q25–q75 209.4–1430)902.41cm-1 — median 504 (q25–q75 216.6–1386)916.45cm-1 — median 485.8 (q25–q75 217.1–1318)930.45cm-1 — median 468.1 (q25–q75 211.2–1135)944.43cm-1 — median 462.6 (q25–q75 212.5–1086)958.38cm-1 — median 443.2 (q25–q75 218.7–1042)972.31cm-1 — median 436.3 (q25–q75 220.7–1003)986.2cm-1 — median 487.5 (q25–q75 242.1–1377)1000.1cm-1 — median 791 (q25–q75 246.5–2117)1013.9cm-1 — median 716.1 (q25–q75 233.2–1769)1027.7cm-1 — median 504.3 (q25–q75 245.1–1043)1041.5cm-1 — median 551.2 (q25–q75 292.2–1173)1055.3cm-1 — median 662.4 (q25–q75 322.6–1966)1069cm-1 — median 532 (q25–q75 324.6–1269)1082.7cm-1 — median 526.6 (q25–q75 289.1–1050)1096.4cm-1 — median 457.8 (q25–q75 262.1–1047)1,110cm-1 — median 400.8 (q25–q75 234.7–955)1123.6cm-1 — median 376.3 (q25–q75 204.2–875.2)1137.2cm-1 — median 377.9 (q25–q75 193.8–907.8)1150.8cm-1 — median 427.9 (q25–q75 172.9–854.2)1164.3cm-1 — median 397.7 (q25–q75 164.5–949.6)1177.8cm-1 — median 415.9 (q25–q75 156.8–848.5)1191.3cm-1 — median 365.2 (q25–q75 157.4–780)1204.8cm-1 — median 360.6 (q25–q75 149.6–756.5)1218.2cm-1 — median 345 (q25–q75 149.5–733.6)1231.6cm-1 — median 373.9 (q25–q75 160.9–716.9)1245cm-1 — median 367.3 (q25–q75 160.6–703.6)1258.3cm-1 — median 375.9 (q25–q75 147–702.2)1271.6cm-1 — median 371.7 (q25–q75 147.8–676.6)1284.9cm-1 — median 370.1 (q25–q75 144.4–672.6)1298.2cm-1 — median 372.6 (q25–q75 146–639.2)1311.5cm-1 — median 373 (q25–q75 153.3–641.9)1324.7cm-1 — median 406 (q25–q75 155.2–732)1337.9cm-1 — median 393.9 (q25–q75 163–755.8)1351cm-1 — median 380.5 (q25–q75 204.1–718.4)1364.2cm-1 — median 375.2 (q25–q75 196.1–696.8)1377.3cm-1 — median 351.9 (q25–q75 212.3–696.4)1390.4cm-1 — median 364.4 (q25–q75 220.4–713.1)1403.4cm-1 — median 374 (q25–q75 213.9–748.2)1416.5cm-1 — median 375 (q25–q75 228.6–611.8)1429.5cm-1 — median 329.4 (q25–q75 212.6–577.8)1442.5cm-1 — median 359.4 (q25–q75 171.7–687.1)1455.4cm-1 — median 321.4 (q25–q75 135.7–568.5)1468.4cm-1 — median 348.9 (q25–q75 131.6–603.3)1481.3cm-1 — median 305.8 (q25–q75 133.1–555.2)1494.2cm-1 — median 295.8 (q25–q75 134.6–524.8)1507cm-1 — median 296.7 (q25–q75 130.6–521.7)1519.8cm-1 — median 293.4 (q25–q75 115.1–510.9)1532.7cm-1 — median 289.2 (q25–q75 93.83–517.3)1545.4cm-1 — median 286.3 (q25–q75 88.42–509.7)1558.2cm-1 — median 287 (q25–q75 86.5–516.6)1570.9cm-1 — median 291.3 (q25–q75 90–497.2)1581.8cm-1 — median 290.7 (q25–q75 87–508.8)1594.5cm-1 — median 288.3 (q25–q75 87.31–481.2)1607.2cm-1 — median 294.7 (q25–q75 84.97–485.7)1619.8cm-1 — median 314.6 (q25–q75 83.42–497.9)1632.4cm-1 — median 306.1 (q25–q75 87.36–487.4)1645cm-1 — median 281.9 (q25–q75 88.17–481)1657.6cm-1 — median 273.4 (q25–q75 81–457.4)1670.1cm-1 — median 274.7 (q25–q75 88.06–455.3)1682.6cm-1 — median 283.5 (q25–q75 90.33–467.3)1695.1cm-1 — median 293.9 (q25–q75 89.97–444)1707.6cm-1 — median 260.3 (q25–q75 86.22–455.9)1720cm-1 — median 263.6 (q25–q75 73.67–436.4)1732.4cm-1 — median 253 (q25–q75 72.47–437.9)1744.8cm-1 — median 259.8 (q25–q75 69.08–429.5)1757.2cm-1 — median 264.5 (q25–q75 70.78–433.8)1769.6cm-1 — median 248.8 (q25–q75 66.86–423.1)1781.9cm-1 — median 243 (q25–q75 68.97–422.4)1794.2cm-1 — median 247.2 (q25–q75 67.72–413)1806.5cm-1 — median 237 (q25–q75 63.97–414.6)1818.7cm-1 — median 231.4 (q25–q75 65.47–406.5)1830.9cm-1 — median 231.9 (q25–q75 64.08–402.1)1843.1cm-1 — median 242.1 (q25–q75 65.47–407)1855.3cm-1 — median 244.8 (q25–q75 66–402.3)1867.5cm-1 — median 243.1 (q25–q75 63.83–393.7)1879.6cm-1 — median 247.4 (q25–q75 62.47–394)1891.7cm-1 — median 248.1 (q25–q75 53.96–382.1)1903.8cm-1 — median 244.8 (q25–q75 58.56–384.4)1915.9cm-1 — median 245.5 (q25–q75 54.64–375.8)1927.9cm-1 — median 248.3 (q25–q75 51.94–373.6)1939.9cm-1 — median 244 (q25–q75 51.03–370.4)1951.9cm-1 — median 241.5 (q25–q75 49.37–364.5)1963.9cm-1 — median 238.2 (q25–q75 48.45–361.7)1975.9cm-1 — median 232.2 (q25–q75 48.96–373.6)1987.8cm-1 — median 241.8 (q25–q75 48.66–369.2)1999.7cm-1 — median 242 (q25–q75 51.01–370.3)

Sampling

Wavelengths972
Axis range102.3–2000 cm-1
Mean spacing1.95 cm-1
Gridirregular
Observations30

Signal & quality

Value range7.25 – 5.46e+04
Mean range584 – 9.12e+03
Mean level1988
Area3.969e+06
PTP8540
Noise RMS7.2926
SNR2.7e+02
SNR dB5e+01 dB
Dynamic range8.54e+03
Smoothness443.9
Saturated0.0%
X-outliers9

Integrity & artefacts

NaN ratio0.00%
Inf count0
Zero ratio0.00%
Spike count1,517
Spike rate5.21%
Jump count3,185
Jump rate10.93%
Clip fraction0.01%

Shape & reference

Baseline slope-4553.4
Curvature RMS276.62
D1 RMS488.73
RMS to mean2612.1
RMS p958515.5
SAM to mean0.92083
SAM p951.2353
Affine offset p953793
Affine gain p95 Δ2.4285
Affine residual p955826.3
Xcorr lag p9544

Outliers & repeatability

PCA Q p95/median3.4
Hotelling T2 p95/median4
Mahalanobis H p95/median2
Repeat groups0

Dimensionality (PCA)

Effective rank7.4
PCs → 95% var13
PCs → 99% var20
Top-10 cum. var92.7%
Computed metric scores 29worst 1.00
FamilleMétrique calculéeValeurScoreNiveauInterprétation datasetCauses typiquesCalcul / scoring
Intégrité des donnéesNaN ratiointegrity.nan_ratio0%0.00faibleSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countintegrity.inf_count00.00faibleNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratiointegrity.zero_ratio0%0.00faibleNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceamplitude.mean_reflectance1987.71.00fortValeur atypique: Trop clair / fond visible ou Trop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveamplitude.area_under_curve3.9688e+061.00fortValeur atypique: Différence d'éclairement ou NormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)amplitude.peak_to_peak8539.70.00faibleVariabilité forteSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceamplitude.variance1.9762e+070.00faibleNormal ou hétérogèneMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSnoise.noise_rms7.29260.02faibleStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRnoise.snr272.560.00faibleBon signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRnoise.bandwise_snr_min48.6260.04faibleZone fiableDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countartefacts.spike_count1,5171.00fortArtefactsCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateartefacts.spike_rate5.21%1.00fortSpectre suspectInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countartefacts.jump_count3,1851.00fortRaccord détecteurSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateartefacts.jump_rate10.9%1.00fortProblème spectralCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionartefacts.clip_fraction0.0103%0.01faibleNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopeshape.baseline_slope-4553.41.00fortDériveÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSshape.curvature_rms276.621.00fortForme inhabituelleFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSshape.d1_rms488.731.00fortSpectre structuréBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)outliers.pca_q_ratio3.3760.42moyenSpectre atypiqueArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²outliers.hotelling_t2_ratio4.04960.51moyenExtrême mais cohérentVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis Houtliers.mahalanobis_h_ratio2.01250.50moyenOutlier globalDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumreference.rms_to_mean_spectrum_p958515.51.00fortSpectre différentDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)reference.sam_to_mean_spectrum_p951.23531.00fortForme différenteFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDrepeatability.rms_intra_id—0.00faibleStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDrepeatability.sam_intra_id—0.00faibleStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDrepeatability.cv_intra_id—0.00faibleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densitystructure.pca_score_density1.5439e-051.00fortSous-populationsLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)structure.local_outlier_factor_p954.05421.00fortSpectre isoléCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scorestructure.isolation_forest_score_p950.562321.00fortSpectre atypiqueDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
X PCA score plot-100,0000100,000200,000300,000-200,000-100,0000100,000200,000PC1 -4.786e+04 · PC2 -1.455e+04PC1 -8674 · PC2 1.072e+04PC1 4.215e+04 · PC2 -4.759e+04PC1 -5.679e+04 · PC2 -3588PC1 -6.14e+04 · PC2 -1.925e+04PC1 6.34e+04 · PC2 1.481e+05PC1 -8852 · PC2 5.541e+04PC1 -9371 · PC2 3.821e+04PC1 -6.096e+04 · PC2 -1.407e+04PC1 2.486e+05 · PC2 -1.267e+05PC1 -5.164e+04 · PC2 2.223e+04PC1 9.772e+04 · PC2 -1.335e+05PC1 8.284e+04 · PC2 -7.267e+04PC1 -2.231e+04 · PC2 1.06e+04PC1 -5.981e+04 · PC2 -1.064e+04PC1 -2.376e+04 · PC2 -6351PC1 -4.823e+04 · PC2 -2.93e+04PC1 -5.76e+04 · PC2 -7654PC1 -5.053e+04 · PC2 2.822e+04PC1 -2.457e+04 · PC2 -2.425e+04PC1 2.15e+04 · PC2 3.842e+04PC1 -6.739e+04 · PC2 -1.512e+04PC1 -5.541e+04 · PC2 -1.151e+04PC1 -3.634e+04 · PC2 2.502e+04PC1 -5.855e+04 · PC2 -3794PC1 -5.017e+04 · PC2 -1.956e+04PC1 2.268e+05 · PC2 1.234e+05PC1 -6.374e+04 · PC2 -4700PC1 1.808e+05 · PC2 5.56e+04PC1 -3.994e+04 · PC2 8880PC1 (42.9%)PC2 (18.3%)30 scores
PCA explained variance0%25%50%75%100%PC1: 42.9% (cumulative 42.9%)1PC2: 18.3% (cumulative 61.2%)2PC3: 9.5% (cumulative 70.7%)3PC4: 6.5% (cumulative 77.3%)4PC5: 4.5% (cumulative 81.7%)5PC6: 2.8% (cumulative 84.5%)6PC7: 2.3% (cumulative 86.9%)7PC8: 2.3% (cumulative 89.2%)8PC9: 1.8% (cumulative 91.0%)9PC10: 1.7% (cumulative 92.7%)10cumulative explained variancePC variancecumulativeprincipal component · cumulative (dashed)

Metric interpretation reference

Metric catalog 29
FamilleMétriqueCe qu’elle détecteForte valeur =Faible valeur =Causes typiquesCalcul / score
Intégrité des donnéesNaN ratioDonnées manquantesSpectre corrompuSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countValeurs infiniesCorruptionNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratioColonnes ou cellules nullesSpectre tronquéNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceNiveau moyenTrop clair / fond visibleTrop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveIntensité globaleDifférence d'éclairementNormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)DynamiqueVariabilité forteSpectre platSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceVariabilité spectraleNormal ou hétérogèneSpectre platMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSBruit haute fréquenceBruitéStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRQualité signalBon signalMauvais signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRBruit localiséZone fiableZone problématiqueDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countPics étroitsArtefactsSpectre propreCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateDensité de picsSpectre suspectNormalInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countDiscontinuitésRaccord détecteurContinuSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateFréquence de sautsProblème spectralNormalCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionSaturationClippingNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopePente globaleDériveStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSCourbureForme inhabituelleLisseFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSVariabilité localeSpectre structuréPlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)Non expliqué par PCASpectre atypiqueConformeArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²Extrême dans PCAExtrême mais cohérentCentralVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis HDistance au nuageOutlier globalPopulation normaleDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumDistance moyenneSpectre différentTypiqueDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)Différence de formeForme différenteSimilaireFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDReproductibilitéMauvaise répétabilitéStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDVariation de formeInstableStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDVariabilité interneMauvais contrôleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densityClustersSous-populationsHomogèneLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)Anomalie localeSpectre isoléPopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scoreAnomalie globaleSpectre atypiqueNormalDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
Technology-specific extensions
TechnologieAdaptations / métriquesAnomalies cibléesCommentaire pratique
UV-Vis 300-1000 nmBaseline, pente globale, dérive aux bords 300-350 et 900-1000; métriques par zonesLumière parasite, mauvais blanc, saturation, faible signal aux extrémitésLes bords sont souvent instables; calculer aussi des scores edge/middle.
UV-Vis 300-1000 nmSaturation / clipping proche absorbance max ou réflectance maxSignal écrêtéTrès important si absorption forte.
UV-Vis 300-1000 nmRed-edge, position de maximum, ratios de bandes si végétalDécalage biologique ou artefact optiqueAide à distinguer changement réel et problème d'acquisition.
UV-Vis 300-1000 nmSmoothness / roughness indexBruit haute fréquenceSouvent plus informatif que le SNR seul.
MIR / ATR-FTIRATR contact quality index: intensité globale, aire totale, profondeur des bandes clésMauvais contact cristal-échantillonCrucial: beaucoup d'anomalies viennent du contact ATR.
MIR / ATR-FTIRCO2 / H2O atmospheric bandsMauvaise correction atmosphériquePics parasites fréquents.
MIR / ATR-FTIRBaseline curvature / rubber-band residualDiffusion, contact, dérive baselineTrès utile avant PCA.
MIR / ATR-FTIRPeak position shiftMauvais alignement spectral / calibrationImportant en FTIR car de petits shifts comptent.
MIR / ATR-FTIRBand area ratios sur bandes connuesSpectre chimiquement incohérentÀ adapter par matrice: polysaccharides, protéines, lipides, etc.
HS-MSTotal Ion Current (TIC), Base Peak Intensity (BPI)Injection faible, ionisation instableÉquivalent MS du niveau global spectral.
HS-MSNombre de pics détectésSpectre pauvre ou trop bruitéTrop peu = mauvais signal; trop = bruit/contamination.
HS-MSMass accuracy / m/z driftProblème calibration masseFondamental en HRMS.
HS-MSRetention time drift si LC/GC-MSDérive chromatographiqueÀ suivre sur standards/QC pools.
HS-MSBlank contamination scoreContaminants / carry-overComparer échantillons vs blancs.
HS-MSInternal standard CVVariabilité instrumentaleTrès robuste si standards disponibles.
HS-MSMissingness par featureInstabilité de détectionCrucial pour filtrer les variables.
Avec répétitionsRMS intra-échantillonRépétabilité globaleApplicable à toutes les technologies.
Avec répétitionsSAM / corrélation intra-échantillonRépétabilité de formeTrès utile pour spectres.
Avec répétitionsCV intra-échantillon par bande / featureRépétabilité localeDétecte les zones instables.
Avec répétitionsICC ou variance componentsPart variance échantillon vs techniqueTrès utile si plusieurs répétitions par sample.
Avec répétitionsDistance au centroïde intra-IDRépétition aberrantePermet de flagger la mauvaise répétition plutôt que le sample entier.
Bug-hunting / supervised audits
Famille de bug potentielMéthodes à ajouterCe que ça détecteÉtat dans l’explorateur
Shift spectral globalCorrélation spectre moyen inter-dataset, DTW, cross-correlation, comparaison positions de picsDécalage en longueur d'onde, mauvais alignement, interpolation différentePartiellement calculé: cross-correlation lag et dispersion des positions de pics vs spectre moyen.
Baseline / offset / gainRégression chaque spectre vs spectre moyen: x = a + b ref + residual; suivi de a, b, RMS résiduelOffset additif, effet multiplicatif, dérive de baselineCalculé dans reference.affine_*.
Mélange de lignes / mauvais appariement X-M-YVérification index, hash des lignes, duplication ID, distance spectrale intra-ID, labels incohérentsLignes mélangées, metadata mal alignées, Y attribué au mauvais spectrePartiellement couvert par répétabilité intra-ID; checks index/hash à ajouter au pipeline canonical.
Fuite d'information / répétitions mal splitéesGroupKFold par sample_id vs StratifiedKFold random; audit des partitions par sample_idPerformance artificiellement bonne due aux répétitionsNécessite splits et benchmark modèle; non calculé par la carte descriptive.
Label bugsÉchantillons proches en X mais Y différents, confident learning, erreurs systématiques FP/FNY inversés, erreurs de saisie, classes ambiguësNécessite Y et/ou modèle; recommandé pour l'explorateur supervisé.
Sous-domaines cachésPCA/UMAP/t-SNE + clustering non supervisé + association avec dataset/Y/date/operatorLots, campagnes, sondes, backgrounds non renseignésPartiellement calculé par structure PCA/LOF; UMAP/t-SNE hors carte statique.
Artefacts localisés inconnusCarte wavelength x dataset: différence moyenne, différence variance, KS par longueur d'ondeRégions spectrales anormales non anticipéesÀ calculer au niveau banque quand plusieurs datasets partagent un axe spectral.
Ruptures instrumentalesDiscontinuités dans dérivées, changepoint detectionSplice, raccord détecteur, saut local non prévuCalculé par jump/spike rates; changepoint plus avancé à ajouter.
Mélange / contamination spectraleNMF / unmixing / reconstruction par convex hullComposante externe: fond, plastique, solNon calculé automatiquement; nécessite hypothèses de composants ou grande bibliothèque.
Features instables mais prédictivesImportance modèle vs instabilité QC par variableModèle qui apprend un artefact plutôt qu'un signal biologiqueNécessite modèle supervisé; recommandé pour rapports de benchmark.

Variables

Targets 4

mineral_name

target · categorical
n / missing30 / 0
Classes30
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classBoron trioxide (1)

chemical_formula_sum

target · categorical
chemical_formula_sum classesO2 TiO2 Ti: 22B2 O3B2 O3: 11C4 Ba O4C4 Ba O4: 11Ba Cr O4Ba Cr O4: 11Ba N2 O6Ba N2 O6: 11Ba O4 SBa O4 S: 11Bi2 O3Bi2 O3: 11Bi N3 O9Bi N3 O9: 11C Bi2 O5C Bi2 O5: 11C Ca O3C Ca O3: 11+10 more+10 more: 1010
n / missing30 / 0
Classes29
Balance (entropy)1
Imbalance ratio2
Top classO2 Ti (2)

compound_source

target · categorical
compound_source classescommercial powder Alfa Aesar …commercial powder Alfa Aesar 99.9%: 33commercial Alfa Aesar 99%commercial Alfa Aesar 99%: 33commercial powder Alfa Aesar …commercial powder Alfa Aesar 99%: 22commercial Alfa Aesar 99.9%commercial Alfa Aesar 99.9%: 22commercial powder Prolabo purcommercial powder Prolabo pur: 22Commercial powder Alfa Aesar …Commercial powder Alfa Aesar 99.98%: 11commercial powder Aldrich 97%commercial powder Aldrich 97%: 11Commercial powder Aldrich 98%Commercial powder Aldrich 98%: 11commercial Prolabo purcommercial Prolabo pur: 11commercial Alfa Aesar 99.5%commercial Alfa Aesar 99.5%: 11+10 more+10 more: 1010
n / missing30 / 0
Classes23
Balance (entropy)0.97
Imbalance ratio3
Top classcommercial powder Alfa Aesar 99.9% (3)

rod_database_code

target · categorical
n / missing30 / 0
Classes30
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top class3500179 (1)

Metadata 5

chemical_name_mineral

metadata · categorical
n / missing30 / 0
Classes30
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classBoron trioxide (1)

chemical_name_systematic

metadata · categorical
n / missing30 / 1
Classes29
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classBoron trioxide (1)

chemical_formula_structural

metadata · categorical
chemical_formula_structural classesO2 TiO2 Ti: 22B2 O3B2 O3: 11Ba (C4 O4)Ba (C4 O4): 11Ba Cr O4Ba Cr O4: 11Ba N2 O6Ba N2 O6: 11Ba SO4Ba SO4: 11Bi2 O3Bi2 O3: 11Bi N3 O9Bi N3 O9: 11Bi2 (C O3) O2Bi2 (C O3) O2: 11C Ca O3C Ca O3: 11+10 more+10 more: 1010
n / missing30 / 0
Classes29
Balance (entropy)1
Imbalance ratio2
Top classO2 Ti (2)

chemical_compound_source

metadata · categorical
chemical_compound_source classescommercial powder Alfa Aesar …commercial powder Alfa Aesar 99.9%: 33commercial Alfa Aesar 99%commercial Alfa Aesar 99%: 33commercial powder Alfa Aesar …commercial powder Alfa Aesar 99%: 22commercial Alfa Aesar 99.9%commercial Alfa Aesar 99.9%: 22commercial powder Prolabo purcommercial powder Prolabo pur: 22Commercial powder Alfa Aesar …Commercial powder Alfa Aesar 99.98%: 11commercial powder Aldrich 97%commercial powder Aldrich 97%: 11Commercial powder Aldrich 98%Commercial powder Aldrich 98%: 11commercial Prolabo purcommercial Prolabo pur: 11commercial Alfa Aesar 99.5%commercial Alfa Aesar 99.5%: 11+10 more+10 more: 1010
n / missing30 / 0
Classes23
Balance (entropy)0.97
Imbalance ratio3
Top classcommercial powder Alfa Aesar 99.9% (3)

publ_section_title

metadata · categorical
n / missing30 / 0
Classes30
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classRaman spectrum of commercial B2O3 (1)
Constant metadata 9
  • axis_digest5b53a6fecfabbeea
  • axis_unitcm^-1
  • axis_min102.3
  • axis_max2000
  • n_points_original972
  • spectroscopy_typeRaman
  • axis_statusreal_common_axis_subset
  • interpolation_appliedfalse
  • journal_year2,018

7 variable(s) omitted (no recorded values).

Alignment

Alignment levelobservation
Sample id availableyes
Samples30
Observations (total)30
Reps per samplemin 1 · mean 1 · max 1

Provenance & citation

ContributorRaman Open Database
Origin · url [open]https://solsa.crystallography.net/rod/
Origin · script [manual]source_to_standard.py — standardization script (maintainer-only)

Governance & integrity

Tierpublic
LicenseCC0-1.0
Permitted useResearch and benchmarking.
Access policyOpen per source license.
RedistributionROD states that all data and the database are CC0/public domain. Users should acknowledge the original authors of the structural data.
Content version1.0.0
Schema / protocol2.0
Content hashc4e6ae3d27d61767…
Processing hash339d466016762799…
Metadata hashf49ce22a6d13813f…

Load this dataset

# pip install nirs4all-datasets
from nirs4all_datasets import get

ds = get("rod_raman_native_axis_972points_5b53a6fe")            # DOI-pinned, checksum-verified, cached
X, y = ds.x(), ds.y()
print(X.shape, y.shape)
card.jsoncroissant.jsonIdentity metadata only — the dataset bytes live at the origin / DOI.