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Privatenative split

roche_type_roche_ts

timeseries · NIR

roche_type_roche_ts. v2.0 standardized NIRS package: 1 spectral source(s), 1 declared target(s). Auto-generated from dataset_card.json (verify before publication).

nirv2timeseries
🔒
Private dataset. Full metadata and metrics are shown, but the bytes are not redistributed here — exporting the data requires a Dataverse token. The identity card carries no spectra, only descriptive statistics.
70
samples
2,844
wavelengths
1
sources
1
targets
14
metadata
NIR
family

Dataset property explorer

Mean profile risk0.53
Highest axisArtefacts locaux · 1.00
Diagnostics8
Sources profiled1
roche_type_roche_ts property profile0.250.50.751integritynoiseartefactsbaselinePCA outliersreferencerepeatabilitystructureroche_type_roche_ts profileintegrity: 0.00noise: 0.01artefacts: 1.00baseline: 1.00PCA outliers: 0.61reference: 1.00repeatability: 0.00structure: 0.59roche_type_roch…0 center · 1 outer ring · outward = stronger anomaly / heterogeneity signal

Profile axes

Intégrité0.00
Artefacts locaux1.00
Bruit0.01
Outliers PCA0.61
Distance à la référence1.00
Répétabilité0.00
Baseline / forme1.00
Structure multi-régimes0.59
Diagnostic hypotheses00.250.50.751hypothesis scoreSplice / raccord détecteursSplice / raccord détecteurs: 0.860.86Erreur calibration / référenc…Erreur calibration / référence blanche: 0.770.77Fond différentFond différent: 0.700.70Erreur interpolation / réécha…Erreur interpolation / rééchantillonnage: 0.670.67Signature VERA25-likeSignature VERA25-like: 0.660.66Différence de sonde / géométr…Différence de sonde / géométrie: 0.610.61Mélange feuille + fondMélange feuille + fond: 0.540.54Spectre hors domaine valideSpectre hors domaine valide: 0.530.53
DiagnosticScoreForceSignauxInterprétation probable
Splice / raccord détecteursX0.86forteSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00Rupture aux jonctions de détecteurs, calibration locale ou sonde différente.
Erreur calibration / référence blancheX0.77forteBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, artefacts locaux 1.00Décalage systématique entre campagnes, instruments ou référence blanche.
Fond différentX0.70moyenneBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.61Effet systématique du support, blanc/noir, transflectance ou environnement de mesure.
Erreur interpolation / rééchantillonnageX0.67moyenneSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, SNR normal/élevé 1.00Artefacts numériques ou traitement spectral incorrect.
Signature VERA25-likeX0.66moyenneSpike rate 1.00, Jump rate 1.00, RMS/SAM référence 1.00Combinaison possible changement de sonde + splice, amplifiée par géométrie, fond ou calibration.
Différence de sonde / géométrieX0.61moyenneBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.61Modification de l'illumination, collecte, angle ou distance sonde-échantillon.
Mélange feuille + fondX0.54moyenneBaseline/mean/area 1.00, RMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.61Couverture partielle du spot; contribution du fond ou du support.
Spectre hors domaine valideX0.53moyenneRMS/SAM référence 1.00, Mahalanobis / T2 0.61, Structure PCA 0.59Variété, espèce, lot ou condition différente mais physiquement plausible.

Spectral sources

recovered_spectra

X · NIR · unknown
recovered_spectra spectra0255075100051015q05-q95 envelopeq25-q75 envelopemedian spectrummedianq25–q75q05–q95wavelength / none14.011none — median 17.72 (q25–q75 10.28–39.24)13.915none — median 19.36 (q25–q75 11.48–41.14)13.815none — median 20.72 (q25–q75 12.01–42.42)13.719none — median 22.59 (q25–q75 12.73–43.11)13.618none — median 24.43 (q25–q75 13.23–44.4)13.523none — median 25.52 (q25–q75 13.63–45.95)13.422none — median 26.46 (q25–q75 13.93–47.2)13.326none — median 27.71 (q25–q75 14.14–48.21)13.226none — median 27.11 (q25–q75 15.42–49.45)13.13none — median 26.8 (q25–q75 15.91–51.77)13.03none — median 27.55 (q25–q75 15.89–53.8)12.934none — median 29.08 (q25–q75 15.73–55.17)12.838none — median 30.06 (q25–q75 15.68–56.31)12.738none — median 29.57 (q25–q75 15.62–57.4)12.642none — median 29.09 (q25–q75 15.81–59.27)12.541none — median 28.67 (q25–q75 15.71–60.36)12.445none — median 28.72 (q25–q75 15.82–61.45)12.345none — median 28.48 (q25–q75 15.64–62.07)12.249none — median 28.66 (q25–q75 15.86–61.82)12.149none — median 28.69 (q25–q75 15.51–61.95)12.053none — median 28.39 (q25–q75 14.95–61.9)11.952none — median 26.61 (q25–q75 13.1–61.58)11.857none — median 28.08 (q25–q75 12.68–61.6)11.761none — median 31.16 (q25–q75 13.21–61.88)11.66none — median 32.32 (q25–q75 13.75–63.73)11.565none — median 35.01 (q25–q75 14.52–65.89)11.464none — median 37.92 (q25–q75 15.83–65.91)11.368none — median 38.96 (q25–q75 16.31–63.11)11.268none — median 39.82 (q25–q75 20.08–66.7)11.172none — median 39.87 (q25–q75 21.71–69.69)11.071none — median 38.69 (q25–q75 23.63–69.75)10.976none — median 39.22 (q25–q75 24.25–70.21)10.875none — median 38.03 (q25–q75 24.62–68.96)10.779none — median 37.86 (q25–q75 23.86–65.41)10.684none — median 38.06 (q25–q75 23.72–65.86)10.583none — median 38.84 (q25–q75 23.3–69.33)10.487none — median 39.4 (q25–q75 23.19–69.37)10.387none — median 39.79 (q25–q75 23.12–69.24)10.291none — median 39.45 (q25–q75 23.02–69.13)10.191none — median 40.7 (q25–q75 22.98–67.47)10.095none — median 40.37 (q25–q75 22.86–66.78)9.9942none — median 39.5 (q25–q75 22.78–67.46)9.8985none — median 37.85 (q25–q75 22.74–66.73)9.8027none — median 38.73 (q25–q75 22.83–64.32)9.7022none — median 37.68 (q25–q75 22.37–64.01)9.6065none — median 36.84 (q25–q75 21.59–63.91)9.5059none — median 34.57 (q25–q75 20.76–62.09)9.4102none — median 31.7 (q25–q75 16.72–59.16)9.3096none — median 30.04 (q25–q75 15.11–55.68)9.2139none — median 29.93 (q25–q75 16.36–56.54)9.1133none — median 34.63 (q25–q75 18.7–59)9.0176none — median 34.18 (q25–q75 17.15–60.65)8.917none — median 35.31 (q25–q75 18.93–60.77)8.8213none — median 35.27 (q25–q75 17.84–59.15)8.7255none — median 34.5 (q25–q75 18.49–59.84)8.625none — median 27.89 (q25–q75 17.52–58.11)8.5293none — median 27.15 (q25–q75 16.39–54.57)8.4287none — median 27.35 (q25–q75 13.49–54.45)8.333none — median 32.18 (q25–q75 17.94–57.86)8.2324none — median 35.99 (q25–q75 17.98–59.26)8.1367none — median 36.03 (q25–q75 18.51–60.18)8.0361none — median 34.99 (q25–q75 18.66–59.16)7.9404none — median 34.79 (q25–q75 17.31–56.86)7.8399none — median 24.25 (q25–q75 12.35–44.67)7.7441none — median 15.89 (q25–q75 7.309–26.38)7.6483none — median 14.69 (q25–q75 7.53–24.7)7.5478none — median 12.92 (q25–q75 6.704–28.28)7.4521none — median 13.91 (q25–q75 7.557–27.92)7.3515none — median 15.53 (q25–q75 7.227–29.83)7.2558none — median 15.61 (q25–q75 7.151–28.6)7.1552none — median 15.02 (q25–q75 7.311–29.59)7.0595none — median 14.78 (q25–q75 7.343–30.14)6.9589none — median 15.36 (q25–q75 7.468–29.63)6.8632none — median 15.18 (q25–q75 7.639–30.55)6.7627none — median 15.1 (q25–q75 7.689–30.91)6.6669none — median 17.87 (q25–q75 7.888–32.61)6.5711none — median 17.46 (q25–q75 8.675–33.68)6.4706none — median 18.27 (q25–q75 9.967–35.49)6.3749none — median 19.47 (q25–q75 10.99–38.72)6.2743none — median 20.03 (q25–q75 10.82–40.63)6.1786none — median 20.57 (q25–q75 9.696–40.46)6.078none — median 20.56 (q25–q75 9.578–37.44)5.9823none — median 20.7 (q25–q75 9.589–35.7)5.8817none — median 21.04 (q25–q75 9.425–36.84)5.786none — median 16.89 (q25–q75 9.861–37.08)5.6855none — median 22.63 (q25–q75 9.942–39.7)5.5897none — median 26.22 (q25–q75 10.58–47.83)5.494none — median 27.11 (q25–q75 13.54–50.33)5.3934none — median 27.69 (q25–q75 13.62–51.6)5.2977none — median 26.36 (q25–q75 12.58–51.4)5.1971none — median 25.61 (q25–q75 10.46–45.09)5.1014none — median 23.07 (q25–q75 9.835–41.66)5.0008none — median 22.3 (q25–q75 9.76–40.7)4.9051none — median 17.34 (q25–q75 7.864–40.26)4.8045none — median 22.95 (q25–q75 9.499–40.26)4.7088none — median 25.28 (q25–q75 9.616–46.94)4.6083none — median 24.3 (q25–q75 11.4–49.23)4.5125none — median 23.27 (q25–q75 12.42–51.18)4.4168none — median 23.09 (q25–q75 11.8–51.54)4.3162none — median 22.85 (q25–q75 11.79–50.41)4.2205none — median 20.76 (q25–q75 9.202–46.01)4.1199none — median 20.34 (q25–q75 9.109–46.24)4.0242none — median 19.83 (q25–q75 8.26–42.45)3.9236none — median 15.54 (q25–q75 6.898–39.75)3.8279none — median 19.9 (q25–q75 7.185–37.18)3.7273none — median 19.37 (q25–q75 5.89–34.08)3.6316none — median 17.15 (q25–q75 5.189–27.08)3.5358none — median 15.91 (q25–q75 4.797–25.17)3.4353none — median 15.4 (q25–q75 4.481–23.24)3.3396none — median 9.837 (q25–q75 4.147–21.42)3.239none — median 6.627 (q25–q75 3.901–20.21)3.1433none — median 5.895 (q25–q75 2.763–17.99)3.0427none — median 7.571 (q25–q75 2.584–15.8)2.947none — median 7.374 (q25–q75 2.56–17.68)2.8464none — median 6.116 (q25–q75 2.235–13.13)2.7507none — median 4.29 (q25–q75 2.211–12.63)2.6501none — median 3.322 (q25–q75 2.151–9.557)2.5544none — median 5.025 (q25–q75 2.745–11.77)2.4586none — median 9.83 (q25–q75 2.785–13.65)2.3581none — median 6.332 (q25–q75 2.758–12.98)2.2624none — median 5.456 (q25–q75 2.587–11.48)2.1618none — median 4.587 (q25–q75 2.31–10.06)2.0661none — median 4.34 (q25–q75 1.821–7.751)1.9655none — median 5.076 (q25–q75 1.63–7.884)1.8698none — median 4.156 (q25–q75 1.537–5.72)1.7692none — median 3.731 (q25–q75 2.077–5.412)1.6735none — median 3.816 (q25–q75 2.304–10.14)1.5729none — median 5.431 (q25–q75 2.609–9.256)1.4772none — median 6.303 (q25–q75 3.711–10.56)1.3814none — median 7.908 (q25–q75 4.167–13.6)1.2809none — median 7.96 (q25–q75 4.238–12.91)1.1852none — median 5.868 (q25–q75 3.936–11.04)1.0846none — median 6.551 (q25–q75 3.838–11.12)0.9889none — median 5.527 (q25–q75 3.439–11.09)0.8883none — median 5.276 (q25–q75 3.41–10.07)0.7926none — median 4.828 (q25–q75 3.883–7.27)0.692none — median 4.689 (q25–q75 3.625–5.645)0.5963none — median 3.432 (q25–q75 2.772–4.497)0.4958none — median 3.326 (q25–q75 2.268–5.021)0.4none — median 2.407 (q25–q75 1.65–3.165)

Sampling

Wavelengths2,844
Axis range0.4–14.01 none
Mean spacing0.00479 none
Gridirregular
Observations70

Signal & quality

Value range0 – 95.2
Mean range2.83 – 45.7
Mean level27.59
Area375.6
PTP42.88
Noise RMS0.014994
SNR1.8e+03
SNR dB7e+01 dB
Dynamic range42.9
Smoothness0.169
Saturated0.0%
X-outliers32

Integrity & artefacts

NaN ratio0.00%
Inf count0
Zero ratio0.01%
Spike count18,551
Spike rate9.32%
Jump count3,261
Jump rate1.64%
Clip fraction0.01%

Shape & reference

Baseline slope36.656
Curvature RMS0.15025
D1 RMS0.17146
RMS to mean18.055
RMS p9534.439
SAM to mean0.29595
SAM p950.4606
Affine offset p9514.743
Affine gain p95 Δ1.0104
Affine residual p9515.934
Xcorr lag p9550

Outliers & repeatability

PCA Q p95/median4.9
Hotelling T2 p95/median4.9
Mahalanobis H p95/median2.2
Repeat groups0

Dimensionality (PCA)

Effective rank2.5
PCs → 95% var4
PCs → 99% var9
Top-10 cum. var99.4%
Computed metric scores 29worst 1.00
FamilleMétrique calculéeValeurScoreNiveauInterprétation datasetCauses typiquesCalcul / scoring
Intégrité des donnéesNaN ratiointegrity.nan_ratio0%0.00faibleSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countintegrity.inf_count00.00faibleNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratiointegrity.zero_ratio0.00502%0.00faibleNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceamplitude.mean_reflectance27.5941.00fortValeur atypique: Trop clair / fond visible ou Trop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveamplitude.area_under_curve375.641.00fortValeur atypique: Différence d'éclairement ou NormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)amplitude.peak_to_peak42.8780.00faibleVariabilité forteSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceamplitude.variance577.980.00faibleNormal ou hétérogèneMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSnoise.noise_rms0.0149940.01faibleStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRnoise.snr1840.30.00faibleBon signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRnoise.bandwise_snr_min26.6710.19faibleZone fiableDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countartefacts.spike_count18,5511.00fortArtefactsCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateartefacts.spike_rate9.32%1.00fortSpectre suspectInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countartefacts.jump_count3,2611.00fortRaccord détecteurSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateartefacts.jump_rate1.64%1.00fortProblème spectralCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionartefacts.clip_fraction0.00553%0.01faibleNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopeshape.baseline_slope36.6561.00fortDériveÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSshape.curvature_rms0.150250.35faibleLisseFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSshape.d1_rms0.171460.08faiblePlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)outliers.pca_q_ratio4.87890.61moyenSpectre atypiqueArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²outliers.hotelling_t2_ratio4.91750.61moyenExtrême mais cohérentVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis Houtliers.mahalanobis_h_ratio2.21760.55moyenOutlier globalDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumreference.rms_to_mean_spectrum_p9534.4391.00fortSpectre différentDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)reference.sam_to_mean_spectrum_p950.46061.00fortForme différenteFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDrepeatability.rms_intra_id0.00faibleStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDrepeatability.sam_intra_id0.00faibleStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDrepeatability.cv_intra_id0.00faibleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densitystructure.pca_score_density0.00241740.59moyenSous-populationsLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)structure.local_outlier_factor_p951.77950.39faiblePopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scorestructure.isolation_forest_score_p950.586110.59moyenSpectre atypiqueDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
X PCA score plot-2,000-1,00001,0002,000-1,500-1,000-50005001,000PC1 -1109 · PC2 -118.3PC1 -1072 · PC2 -144.6PC1 -632.7 · PC2 123.4PC1 -311.7 · PC2 484PC1 -373.9 · PC2 608.7PC1 820.2 · PC2 -37.51PC1 1976 · PC2 -204.4PC1 1828 · PC2 -126.3PC1 1355 · PC2 -418.1PC1 865.1 · PC2 -1086PC1 121.5 · PC2 -405.6PC1 54.43 · PC2 -294.2PC1 1073 · PC2 219.3PC1 -31.54 · PC2 -178.1PC1 1434 · PC2 566.1PC1 876.3 · PC2 777.2PC1 -1054 · PC2 -97.02PC1 -1236 · PC2 -18.35PC1 -1089 · PC2 -68.83PC1 -484.1 · PC2 -227.7PC1 -818.4 · PC2 250.8PC1 178.8 · PC2 411.9PC1 -1031 · PC2 -127.7PC1 -1264 · PC2 -40.32PC1 -1280 · PC2 -113PC1 -451.9 · PC2 321.1PC1 69.1 · PC2 376PC1 -1080 · PC2 11.27PC1 358.6 · PC2 137.5PC1 -1025 · PC2 -81.9PC1 -524.2 · PC2 112.7PC1 -681 · PC2 -249.3PC1 -408.8 · PC2 319.4PC1 -1041 · PC2 -65.55PC1 -490.2 · PC2 214.3PC1 56.47 · PC2 629PC1 -1309 · PC2 -81.88PC1 -1435 · PC2 -62.4PC1 25.93 · PC2 214.4PC1 -1216 · PC2 -71.16PC1 -1178 · PC2 -40.85PC1 268.8 · PC2 -624.8PC1 659.8 · PC2 -1076PC1 1055 · PC2 -84.91PC1 -525.1 · PC2 -375.6PC1 116.4 · PC2 -1087PC1 320.9 · PC2 -848.4PC1 1990 · PC2 -228.3PC1 -525.1 · PC2 -375.6PC1 1684 · PC2 -256.8PC1 1406 · PC2 73.5PC1 1304 · PC2 305.5PC1 238.8 · PC2 -35.22PC1 1799 · PC2 231.5PC1 1192 · PC2 519.1PC1 735.8 · PC2 -360.4PC1 -569.5 · PC2 80.24PC1 -957.9 · PC2 49.74PC1 740.8 · PC2 358.1PC1 -780.7 · PC2 60.6PC1 405.1 · PC2 527PC1 -60.97 · PC2 427.8PC1 1641 · PC2 164.6PC1 724.1 · PC2 -517PC1 -50.82 · PC2 315.7PC1 -756.3 · PC2 188.8PC1 490.7 · PC2 512.9PC1 -799.5 · PC2 46.93PC1 -777.7 · PC2 113PC1 564.8 · PC2 477.9PC1 (76.8%)PC2 (12.6%)70 scores
PCA explained variance0%25%50%75%100%PC1: 76.8% (cumulative 76.8%)1PC2: 12.6% (cumulative 89.4%)2PC3: 4.4% (cumulative 93.8%)3PC4: 2.4% (cumulative 96.2%)4PC5: 1.2% (cumulative 97.4%)5PC6: 0.7% (cumulative 98.0%)6PC7: 0.5% (cumulative 98.5%)7PC8: 0.4% (cumulative 99.0%)8PC9: 0.2% (cumulative 99.2%)9PC10: 0.2% (cumulative 99.4%)10cumulative explained variancePC variancecumulativeprincipal component · cumulative (dashed)

Metric interpretation reference

Metric catalog 29
FamilleMétriqueCe qu’elle détecteForte valeur =Faible valeur =Causes typiquesCalcul / score
Intégrité des donnéesNaN ratioDonnées manquantesSpectre corrompuSpectre completErreur acquisition/exportcount(isnan(X)) / X.sizealert = min(1, nan_ratio / 0.05)
Intégrité des donnéesInf countValeurs infiniesCorruptionNormalCalculs invalidescount(isinf(X))alert = min(1, inf_count / 1)
Intégrité des donnéesZero ratioColonnes ou cellules nullesSpectre tronquéNormalExport, saturationcount(X == 0) / count(finite X)alert = min(1, zero_ratio / 0.05)
Amplitude globaleMean reflectanceNiveau moyenTrop clair / fond visibleTrop sombreFond, géométriemean(X finite)alert reuses baseline/shape drift because absolute reflectance ranges are technology-dependent
Amplitude globaleArea under curveIntensité globaleDifférence d'éclairementNormalDistance sondetrapezoid(mean_spectrum, spectral_axis)alert reuses baseline/shape drift because area scale depends on axis and units
Amplitude globalePeak-to-peak (PTP)DynamiqueVariabilité forteSpectre platSaturationmax(mean_spectrum) - min(mean_spectrum)alert increases when dynamic range is abnormally flat
Amplitude globaleVarianceVariabilité spectraleNormal ou hétérogèneSpectre platMauvais contactvar(X finite)alert increases when variance/dynamic range is abnormally flat
BruitNoise RMSBruit haute fréquenceBruitéStableLampe, détecteurmedian MAD(second derivative) * 1.4826 / sqrt(6)alert = noise_rms / signal_scale, saturated at 5%
BruitSNRQualité signalBon signalMauvais signalAcquisitionmean(abs(X)) / noise_rmsalert decreases with SNR dB; >=40 dB is treated as low alert
BruitBandwise SNRBruit localiséZone fiableZone problématiqueDétecteurmin(abs(mean_spectrum) / local second-derivative noise)alert decreases with worst-band SNR dB; >=35 dB is treated as low alert
Artefacts locauxSpike countPics étroitsArtefactsSpectre propreCosmic rays, splicecount robust outliers in second derivativealert follows spike_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxSpike rateDensité de picsSpectre suspectNormalInterpolationspike_count / (n_samples * (n_features - 2))alert = min(1, spike_rate / 0.01)
Artefacts locauxJump countDiscontinuitésRaccord détecteurContinuSplicecount robust outliers in first derivativealert follows jump_rate, saturated at 1%
Artefacts locauxJump rateFréquence de sautsProblème spectralNormalCalibrationjump_count / (n_samples * (n_features - 1))alert = min(1, jump_rate / 0.01)
Artefacts locauxClip fractionSaturationClippingNormalDétecteur saturéfraction of finite cells equal to repeated min/max extremaalert = min(1, clip_fraction / 0.01)
Forme spectraleBaseline slopePente globaleDériveStableÉclairementlinear slope of mean_spectrum over normalized axisalert = abs(slope / signal_scale), saturated at 0.5
Forme spectraleCurvature RMSCourbureForme inhabituelleLisseFond, splicemedian RMS(second derivative per spectrum)alert = curvature_rms / signal_scale, saturated at 1%
Forme spectraleD1 RMSVariabilité localeSpectre structuréPlatBiologie ou artefactmedian RMS(first derivative per spectrum)alert = d1_rms / signal_scale, saturated at 5%
Outliers multivariésPCA Q (SPE)Non expliqué par PCASpectre atypiqueConformeArtefact, mélangep95(Q/SPE residual) / median(Q/SPE residual)alert = min(1, pca_q_ratio / 8)
Outliers multivariésHotelling T²Extrême dans PCAExtrême mais cohérentCentralVariabilité naturellep95(Hotelling T2) / median(Hotelling T2)alert = min(1, hotelling_t2_ratio / 8)
Outliers multivariésMahalanobis HDistance au nuageOutlier globalPopulation normaleDomaine différentp95(sqrt(T2)) / median(sqrt(T2))alert = min(1, mahalanobis_h_ratio / 4)
Comparaison à référenceRMS to mean spectrumDistance moyenneSpectre différentTypiqueDomain shiftp95 RMS distance to dataset mean spectrumalert = RMS_p95 / signal_scale, saturated at 25%
Comparaison à référenceSpectral Angle Mapper (SAM)Différence de formeForme différenteSimilaireFond, géométriep95 spectral angle to dataset mean spectrumalert = min(1, SAM_p95 / 0.35 rad)
RépétabilitéRMS intra-IDReproductibilitéMauvaise répétabilitéStablePositionnementmedian RMS distance to repeated-sample centroidalert = RMS_intra_ID / signal_scale, saturated at 10%
RépétabilitéSAM intra-IDVariation de formeInstableStableAcquisitionmedian SAM to repeated-sample centroidalert = min(1, SAM_intra_ID / 0.15 rad)
RépétabilitéCV intra-IDVariabilité interneMauvais contrôleStableOpérateurmedian within-ID band CValert = min(1, CV_intra_ID / 0.25)
Structure du datasetPCA score densityClustersSous-populationsHomogèneLots différents1 / median kNN distance in PCA score spacealert follows density_cv/profile structure complexity, not raw density alone
Structure du datasetLocal Outlier Factor (LOF)Anomalie localeSpectre isoléPopulation normaleCas raresp95 approximate LOF from PCA-score kNN distancesalert = min(1, max(0, LOF_p95 - 1) / 2)
Structure du datasetIsolation Forest scoreAnomalie globaleSpectre atypiqueNormalDiverses causesp95 IsolationForest anomaly score on PCA scoresalert follows structure complexity; raw score is implementation-dependent
Technology-specific extensions
TechnologieAdaptations / métriquesAnomalies cibléesCommentaire pratique
UV-Vis 300-1000 nmBaseline, pente globale, dérive aux bords 300-350 et 900-1000; métriques par zonesLumière parasite, mauvais blanc, saturation, faible signal aux extrémitésLes bords sont souvent instables; calculer aussi des scores edge/middle.
UV-Vis 300-1000 nmSaturation / clipping proche absorbance max ou réflectance maxSignal écrêtéTrès important si absorption forte.
UV-Vis 300-1000 nmRed-edge, position de maximum, ratios de bandes si végétalDécalage biologique ou artefact optiqueAide à distinguer changement réel et problème d'acquisition.
UV-Vis 300-1000 nmSmoothness / roughness indexBruit haute fréquenceSouvent plus informatif que le SNR seul.
MIR / ATR-FTIRATR contact quality index: intensité globale, aire totale, profondeur des bandes clésMauvais contact cristal-échantillonCrucial: beaucoup d'anomalies viennent du contact ATR.
MIR / ATR-FTIRCO2 / H2O atmospheric bandsMauvaise correction atmosphériquePics parasites fréquents.
MIR / ATR-FTIRBaseline curvature / rubber-band residualDiffusion, contact, dérive baselineTrès utile avant PCA.
MIR / ATR-FTIRPeak position shiftMauvais alignement spectral / calibrationImportant en FTIR car de petits shifts comptent.
MIR / ATR-FTIRBand area ratios sur bandes connuesSpectre chimiquement incohérentÀ adapter par matrice: polysaccharides, protéines, lipides, etc.
HS-MSTotal Ion Current (TIC), Base Peak Intensity (BPI)Injection faible, ionisation instableÉquivalent MS du niveau global spectral.
HS-MSNombre de pics détectésSpectre pauvre ou trop bruitéTrop peu = mauvais signal; trop = bruit/contamination.
HS-MSMass accuracy / m/z driftProblème calibration masseFondamental en HRMS.
HS-MSRetention time drift si LC/GC-MSDérive chromatographiqueÀ suivre sur standards/QC pools.
HS-MSBlank contamination scoreContaminants / carry-overComparer échantillons vs blancs.
HS-MSInternal standard CVVariabilité instrumentaleTrès robuste si standards disponibles.
HS-MSMissingness par featureInstabilité de détectionCrucial pour filtrer les variables.
Avec répétitionsRMS intra-échantillonRépétabilité globaleApplicable à toutes les technologies.
Avec répétitionsSAM / corrélation intra-échantillonRépétabilité de formeTrès utile pour spectres.
Avec répétitionsCV intra-échantillon par bande / featureRépétabilité localeDétecte les zones instables.
Avec répétitionsICC ou variance componentsPart variance échantillon vs techniqueTrès utile si plusieurs répétitions par sample.
Avec répétitionsDistance au centroïde intra-IDRépétition aberrantePermet de flagger la mauvaise répétition plutôt que le sample entier.
Bug-hunting / supervised audits
Famille de bug potentielMéthodes à ajouterCe que ça détecteÉtat dans l’explorateur
Shift spectral globalCorrélation spectre moyen inter-dataset, DTW, cross-correlation, comparaison positions de picsDécalage en longueur d'onde, mauvais alignement, interpolation différentePartiellement calculé: cross-correlation lag et dispersion des positions de pics vs spectre moyen.
Baseline / offset / gainRégression chaque spectre vs spectre moyen: x = a + b ref + residual; suivi de a, b, RMS résiduelOffset additif, effet multiplicatif, dérive de baselineCalculé dans reference.affine_*.
Mélange de lignes / mauvais appariement X-M-YVérification index, hash des lignes, duplication ID, distance spectrale intra-ID, labels incohérentsLignes mélangées, metadata mal alignées, Y attribué au mauvais spectrePartiellement couvert par répétabilité intra-ID; checks index/hash à ajouter au pipeline canonical.
Fuite d'information / répétitions mal splitéesGroupKFold par sample_id vs StratifiedKFold random; audit des partitions par sample_idPerformance artificiellement bonne due aux répétitionsNécessite splits et benchmark modèle; non calculé par la carte descriptive.
Label bugsÉchantillons proches en X mais Y différents, confident learning, erreurs systématiques FP/FNY inversés, erreurs de saisie, classes ambiguësNécessite Y et/ou modèle; recommandé pour l'explorateur supervisé.
Sous-domaines cachésPCA/UMAP/t-SNE + clustering non supervisé + association avec dataset/Y/date/operatorLots, campagnes, sondes, backgrounds non renseignésPartiellement calculé par structure PCA/LOF; UMAP/t-SNE hors carte statique.
Artefacts localisés inconnusCarte wavelength x dataset: différence moyenne, différence variance, KS par longueur d'ondeRégions spectrales anormales non anticipéesÀ calculer au niveau banque quand plusieurs datasets partagent un axe spectral.
Ruptures instrumentalesDiscontinuités dans dérivées, changepoint detectionSplice, raccord détecteur, saut local non prévuCalculé par jump/spike rates; changepoint plus avancé à ajouter.
Mélange / contamination spectraleNMF / unmixing / reconstruction par convex hullComposante externe: fond, plastique, solNon calculé automatiquement; nécessite hypothèses de composants ou grande bibliothèque.
Features instables mais prédictivesImportance modèle vs instabilité QC par variableModèle qui apprend un artefact plutôt qu'un signal biologiqueNécessite modèle supervisé; recommandé pour rapports de benchmark.

Variables

Targets 1

type_roche

target · categorical
type_roche classes00: 262633: 191911: 141422: 1111
n / missing70 / 0
Classes4
Balance (entropy)0.96
Imbalance ratio2
Top class0 (26)

Metadata 5

ID_sample

metadata · categorical
n / missing70 / 0
Classes70
Balance (entropy)1
Imbalance ratio1
Top classRock_train_0001 (1)

split

metadata · categorical
split classestesttest: 5050traintrain: 2020
n / missing70 / 0
Classes2
Balance (entropy)0.86
Imbalance ratio2
Top classtest (50)

raw_label

metadata · categorical
raw_label classes11: 262644: 191922: 141433: 1111
n / missing70 / 0
Classes4
Balance (entropy)0.96
Imbalance ratio2
Top class1 (26)

reference_value

metadata · categorical
reference_value classesmaficmafic: 2626schistschist: 1919quartzitequartzite: 1414marblemarble: 1111
n / missing70 / 0
Classes4
Balance (entropy)0.96
Imbalance ratio2
Top classmafic (26)

class_index

metadata · categorical
class_index classes00: 262633: 191911: 141422: 1111
n / missing70 / 0
Classes4
Balance (entropy)0.96
Imbalance ratio2
Top class0 (26)
Constant metadata 9
  • SpectralRep1
  • datasetRock
  • productroche
  • trait_headertype_roche
  • trait_descriptionType de roche.
  • spectroreflectance spectrale
  • dimensions1
  • feature_count_per_dimension2,844
  • wavelength_noteSources ASTER/ECOSTRESS: les spectres All de la bibliotheque ASTER ont 2844 valeurs de X, de 14.0110 a 0.4000 um. La partie VSWIR Beckman est documentee sur 0.4-2.5 um avec un pas de 0.001 um de 0.4 a 0.8 puis 0.004 um de 0.8 a 2.5, mais le vecteur bande-a-bande fusionne n'est pas fourni dans l'archive Rock, axe lineaire interpole applique ici en ordre decroissant 14.0110->0.4000 sur 2844 variables.

Alignment

Alignment levelobservation
Sample id availableno
Samples70
Observations (total)70
Reps per samplemin 1 · mean 1 · max 1

Splits

originaltest: 50, train: 20 documented · not applied

Provenance & citation

Contributortimeseries_classif_nirs_database
Origin · url [open]https://www.timeseriesclassification.com/aeon-toolkit/Rock.zip
Origin · url [open]https://www.timeseriesclassification.com/description.php?Dataset=Rock
Origin · script [manual]source_to_standard.py — standardization script (maintainer-only)

Governance & integrity

Tierprivate
LicenseLicenseRef-not-cleared
Permitted useResearch and benchmarking; private use only.
Access policyManual download / private-use-only per source.
RedistributionRecovered from local initial-source exports; rights not cleared for redistribution.
Content version1.0.0
Schema / protocol2.0
Content hashf13d5758243042ca…
Processing hash446387bb317f4cf1…
Metadata hash2e50b96301c8eab8…

Load this dataset

# pip install nirs4all-datasets
from nirs4all_datasets import get

# private dataset — export requires a Dataverse token
ds = get("timeseries_roche_type_roche_ts", token="…")
X, y = ds.x(), ds.y()
print(X.shape, y.shape)

Metadata downloads are available for public datasets only. The dataset bytes are never served here — fetch them from the origin / DOI above.